Lateral dissemination and inter-patient transmission of<i>bla</i><sub>KPC-3</sub>: role of a conjugative plasmid in spreading carbapenem resistance
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: The objective of this study was to describe the nosocomial spread of carbapenemase-producing enterobacteria and characterize a plasmid involved in KPC dissemination. METHODS: Two Klebsiella pneumoniae, one Escherichia coli and one Citrobacter freundii isolated from two patients were studied. Susceptibility profiles were obtained using Etest. Carbapenemase activity was detected using the Carba NP test. β-Lactamase gene content was screened by PCR and sequencing. K. pneumoniae isolates were genotyped by MLST and PFGE. KPC plasmid sizes were estimated by S1-DNA digestion and PFGE-Southern blot. Plasmids were sequenced using Illumina's technology and Sanger sequencing. RESULTS: Two patients sharing a room on a surgical unit were positive for carbapenemase-producing K. pneumoniae. One patient was also colonized with carbapenemase-producing C. freundii and E. coli. Neither patient had known risk factors for carbapenemase acquisition, although one patient had recent surgery at another Toronto hospital; the other patient's husband had surgery in New York City 3 years prior to her presentation. An extensive investigation was conducted at both hospitals, but no additional cases were identified. blaKPC-3 was detected in all clinical isolates. Variable carbapenem resistance levels were observed. Both K. pneumoniae belonged to the same clone by PFGE and MLST (ST277). pKPC-SMH (∼ 53 kb) was identified in all the clinical isolates, showing identity only with structurally similar IncN plasmids. CONCLUSIONS: We describe intra- and inter-patient dissemination of blaKPC. The involvement of a clone related to the successful K. pneumoniae ST258 and the blaKPC-3 gene detected in an active Tn4401 transposon carried on a conjugative broad-host-range plasmid increased the potential for this horizontal transmission.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».