Notice bibliographique
Résumé
Abstract KshAB is a Rieske oxygenase (RO) in the aerobic steroid degradation pathways of bacteria. It is a monooxygenase responsible for the 9α‐hydroxylation of the nucleus of 3‐keto‐4‐ene steroids bearing short side chains at C17. It is composed of two domains arranged in a head‐to‐tail fashion to form the functional trimer. The N‐terminal Rieske domain harbors a Fe 2 S 2 cluster in which the two irons are coordinated by two cysteine and two histidine residues, respectively. The larger, C‐terminal catalytic domain contains a mononuclear nonheme iron coordinated by a His‐His‐Asp facial triad. Purified KshAB from Mycobacterium tuberculosis exhibits substrate specificities for 1,4‐androstadien‐3,17‐one and dioxygen 2‐3 orders of magnitude lower than those measured for other ROs and their best substrates. In agreement with the large fused‐ring substrate, the structure of KshA incorporates an active site channel and substrate binding pocket that are longer than those observed in other ROs, and positioned in a different relative orientation within the catalytic domain. KshA also possesses a C‐terminal helix which occupies a position not observed in other RO structures and which likely stabilizes trimeric quaternary structure. Finally, KshA exhibits a minimal core catalytic domain with respect to secondary structural elements that may prove archetypical for ROs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».