CD8A gene polymorphisms predict severity factors in chronic rhinosinusitis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: A genetic basis to chronic rhinosinusitis (CRS) is postulated, but remains elusive. We have recently identified low levels of circulating CD8 lymphocytes as a frequent finding in difficult-to-treat or refractory CRS. In major histocompatibility complex 1 class 1 (MHC1) deficiency, low circulating levels of CD8 lymphocytes secondary to mutations in the cluster of differentiation 8a (CD8A), tapasin 1 (TAP1), tapasin 2 (TAP2), or tapasin binding-protein (TAPBP) genes lead to a clinical syndrome, which is associated with severe CRS. The objective of this work was to identify whether genetic factors associated with MHC1 deficiency are present in CRS. METHODS: Previous results from a genomewide association study of CRS were screened for polymorphisms in the CD8A, TAP1, TAP2, and TAPBP genes associated with MHC1 immunodeficiency syndrome. Significant polymorphisms were tested for associations with demographic factors characterizing severe CRS. RESULTS: Polymorphisms in the CD8A (rs3810831) and TAPBP (rs2282851) genes were significantly associated with CRS. Major allele homozygosity for CD8A (rs3810831) was associated with a higher frequency of affected relatives (p = 0.052), increased severity as characterized by age at diagnosis (p = 0.009), age at first surgery (p = 0.004), and number of surgeries (p = 0.008), whereas TAPBP (rs2282851) was associated increased risk for CRS (odds ratio [OR] = 2.48, p = 0.0076). CONCLUSION: Modified CD8A or TAPBP gene function may contribute to the development of refractory CRS via altered MHC1 function and reduction of circulating CD8 lymphocytes. Identification of markers in the CD8A or TAPBP genes via sequencing may offer a basis for genetic testing in CRS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».