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Enregistrement W1945289679 · doi:10.1155/2011/712350

Assessing Inflammatory Bowel Disease-Associated Antibodies in Caucasian and First Nations Cohorts

2011· article· en· W1945289679 sur OpenAlexafffundvenueabout
Çharles N. Bernstein, Hani El‐Gabalawy, Michael Sargent, Carol J. Landers, Patricia Rawsthorne, Brenda Elias, Stephan R. Targan

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Gastroenterology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCrohn's and Colitis FoundationCrohn's and Colitis Foundation of CanadaUniversity of ManitobaCanadian Institutes of Health ResearchAbbott CanadaAstraZeneca Canada
Mots-clésMedicineUlcerative colitisPancaInflammatory bowel diseaseImmunologyCrohn's diseaseAntibodyPopulationPancolitisAnti-neutrophil cytoplasmic antibodyInternal medicineDiseaseGastroenterologyVasculitisCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: First Nation populations in Canada have a very low incidence of inflammatory bowel disease (IBD). Based on typical infections in this population, it is plausible that the First Nations react differently to microbial antigens with a different antibody response pattern, which may shed some light as to why they experience a low rate of IBD. OBJECTIVE: To compare the positivity rates of antibodies known to be associated with IBD in Canadian First Nations compared with a Canadian Caucasian population. METHODS: Subjects with Crohn's disease, ulcerative colitis (UC), rheumatoid arthritis (RA) (as an immune disease control) and healthy controls without a personal or family history of chronic immune diseases, were enrolled in a cohort study aimed to determine differences between First Nations and Caucasians with IBD or RA. Serum from a random sample of these subjects (n=50 for each of First Nations with RA, First Nations controls, Caucasians with RA, Caucasians with Crohn's disease, Caucasians with UC and Caucasians controls, and as many First Nations with either Crohn's disease or UC as could be enrolled) was analyzed in the laboratory for the following antibodies: perinuclear antineutrophil cytoplasmic antibody (pANCA), and four Crohn's disease-associated antibodies including anti-Saccharomyces cerevisiae, the outer membrane porin C of Escherichia coli, I2 - a fragment of bacterial DNA associated with Pseudomonas fluorescens, and the bacterial flagellin CBir-1. The rates of positive antibody responses and mean titres among positive results were compared. RESULTS: For pANCA, First Nations had a positivity rate of 55% in those with UC, 32% in healthy controls and 48% in those with RA. The pANCA positivity rate was 32% among Caucasians with RA. The rates of the Crohn's disease-associated antibodies for the First Nations and Caucasians were comparable. Among First Nations, up to one in four healthy controls were positive for any one of the Crohn's disease-associated antibodies. First Nations had significantly higher pANCA titres in both the UC and RA groups than Caucasians. DISCUSSION: Although First Nation populations experience a low rate of IBD, they are relatively responsive to this particular antibody panel. CONCLUSIONS: The positivity rates of these antibodies in First Nations, despite the low incidence of IBD in this population, suggest that these antibodies are unlikely to be of pathogenetic significance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,592
Score d'incertitude au seuil0,812

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2011
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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