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Enregistrement W1947231608 · doi:10.1523/jneurosci.20-02-00709.2000

A Highly Conserved Enhancer in the<i>Dlx5/Dlx6</i>Intergenic Region is the Site of Cross-Regulatory Interactions between<i>Dlx</i>Genes in the Embryonic Forebrain

2000· article· en· W1947231608 sur OpenAlexafffund
Ted Zerucha, Thorsten Stühmer, Gary Hatch, Byung K. Park, Qiaoming Long, Guoying Karen Yu, Adrianna Gambarotta, Joshua R. Schultz, John L.R. Rubenstein, Marc Ekker

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDeutscher Akademischer AustauschdienstMarch of Dimes Foundation
Mots-clésDLX5ZebrafishBiologyForebrainHomeoboxEnhancerGeneticsGeneHomeotic geneGene expressionNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Four Dlx homeobox genes, Dlx1, Dlx2, Dlx5, and Dlx6 are expressed in the same primordia of the mouse forebrain with temporally overlapping patterns. The four genes are organized as two tail-to-tail pairs, Dlx1/Dlx2 and Dlx5/Dlx6, a genomic arrangement conserved in distantly related vertebrates like zebrafish. The Dlx5/Dlx6 intergenic region contains two sequences of a few hundred base pairs, remarkably well conserved between mouse and zebrafish. Reporter transgenes containing these two sequences are expressed in the forebrain of transgenic mice and zebrafish with patterns highly similar to endogenous Dlx5 and Dlx6 expression. The activity of the transgene is drastically reduced in mouse mutants lacking both Dlx1 and Dlx2, consistent with the decrease in endogenous Dlx5 and Dlx6 expression. These results suggest that cross-regulation by Dlx proteins, mediated by the intergenic sequences, is essential for Dlx5 and Dlx6 expression in the forebrain. This hypothesis is supported by cotransfection and DNA-protein binding experiments. We propose that the Dlx genes are part of a highly conserved developmental pathway that regulates forebrain development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations367
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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