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Enregistrement W1947375162 · doi:10.1111/j.1365-2958.2005.04833.x

The <i>Helicobacter pylori</i> MutS protein confers protection from oxidative DNA damage

2005· article· en· W1947375162 sur OpenAlexafffund
Ge Wang, Praveen Alamuri, M. Zafri Humayun, Diane E. Taylor, Robert J. Maier

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of General Medical SciencesU.S. Public Health ServiceNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteAlberta Heritage Foundation for Medical Research
Mots-clésBiologyOxidative stressMutagenesisMutantDNADNA damageHelicobacter pyloriDNA mismatch repairMolecular biologyDNA repairOxidative phosphorylationWild typeGeneticsBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human gastric pathogenic bacterium Helicobacter pylori lacks a MutSLH-like DNA mismatch repair system. Here, we have investigated the functional roles of a mutS homologue found in H. pylori, and show that it plays an important physiological role in repairing oxidative DNA damage. H. pylori mutS mutants are more sensitive than wild-type cells to oxidative stress induced by agents such as H2O2, paraquat or oxygen. Exposure of mutS cells to oxidative stress results in a significant ( approximately 10-fold) elevation of mutagenesis. Strikingly, most mutations in mutS cells under oxidative stress condition are G:C to T:A transversions, a signature of 8-oxoguanine (8-oxoG). Purified H. pylori MutS protein binds with a high specific affinity to double-stranded DNA (dsDNA) containing 8-oxoG as well as to DNA Holliday junction structures, but only weakly to dsDNA containing a G:A mismatch. Under oxidative stress conditions, mutS cells accumulate higher levels (approximately threefold) of 8-oxoG DNA lesions than wild-type cells. Finally, we observe that mutS mutant cells have reduced colonization capacity in comparison to wild-type cells in a mouse infection model.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,212
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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