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Enregistrement W1948045193

Sequence analysis, pathogenicity and cytokine gene expression patterns associated with fowl adenovirus infection

2012· dissertation· en· W1948045193 sur OpenAlexfundno aff
Helena Grgić

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Agriculture, Food and Rural AffairsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsPoultry Industry Council
Mots-clésBiologyVirologySerotypeGooseVirusGeneFowlGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The family Adenoviridae consists of five genera, including the genus Aviadenovirus, which infects avian species. The genus Aviadenovirus currently comprises five fowl (Fowl adenovirus A-E), one falcon (Falcon adenovirus A), and one goose (Goose adenovirus) adenovirus species. Fowl adenoviruses (FAdVs) have a worldwide distribution. Some are associated with diseases such as inclusion body hepatitis (IBH), while FAdV species C serotype 4 (FAdV-4) has been associated with hydropericardium-hepatitis syndrome (HHS). In this study, the complete nucleotide sequence of fowl adenovirus serotype 8 (FAdV-8) was determined. The full genome was 44,055 nucleotides (nt) in length, with an organization similar to that of the FAdV-1 and FAdV-9 genomes. No regions homologous to early regions E1, E3, and E4 of mastadenoviruses were recognized Pathogenicity of FAdV-8 and FAdV-4 were studied in specific-pathogen-free chickens following oral and intramuscular inoculations. Pathogenicity was determined on the basis of clinical signs and gross and histological lesions. Additionally, virus shedding and viral genome copy numbers in liver, cecal tonsil, and bursa of Fabricius were determined. The role of interleukins (IL) in the pathogenicity of and immune response to FAdVs is unknown. Therefore, in a chicken experiment, interferon-γ, IL-10, IL-18, and IL-8 gene expression was evaluated following FAdV-8 and FAdV-4 infection. Cytokine gene expression was examined in the liver, spleen, and cecal tonsils. This study explored the ability of fowl adenoviruses to subvert the host cell’s secretion of cytokines in response to infection as an important viral mechanism for immune evasion during infection. Variations in virulence of FAdVs are likely to be determined by the fiber alone as shown by Pallister et al. (1996). Therefore, we compared and analyzed the nt and amino acid (aa) sequences of the fiber gene of pathogenic and non-pathogenic FAdVs representing species groups D (FAdV-11) and E (FAdV-8). According to our data, virulence might not be associated only with sequence of the fiber gene. This work is a continuation of our efforts towards better understanding of the molecular biology of FAdVs and the pathogenesis of the disease, with an emphasis on the role of interleukins, an unknown area.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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