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Enregistrement W1948902556 · doi:10.1093/genetics/164.4.1419

Identification of <i>Trans</i>-dominant Modifiers of <i>Prat</i> Expression in <i>Drosophila melanogaster</i>

2003· article· en· W1948902556 sur OpenAlexaff
Nicolas Malmanche, Denise V. Clark

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDrosophila melanogasterGeneticsEnhancerGeneVariegation (histology)Reporter geneCoding regionCis-regulatory moduleCompound eyeMolecular biologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The first committed step in the purine de novo synthesis pathway is performed by amidophosphoribosyltransferase (EC 2.4.2.14) or Prat. Drosophila melanogaster Prat is an essential gene with a promoter that lacks a TATA-box and initiator element and has multiple transcription start sites with a predominant start site. To study the regulation of Prat expression in the adult eye, we used the Prat:bw reporter gene, in which the Prat coding region was replaced with the brown (bw) coding region. The pale-orange eye color of a single copy of Prat:bw prompted us to use a multicopy array of Prat:bw that was derived using P transposase mutagenesis and produces a darker-orange eye color in a bw(D); st genetic background. We used a 13-copy array of Prat:bw as a tool to recover dominant EMS-induced mutations that affect the expression of the transgene. After screening 21,000 F(1)s for deviation from the orange eye color, we isolated 23 dominant modifiers: 21 suppressors (1 Y-linked, 5 X-linked, 4 2-linked, and 11 3-linked) and 2 enhancers (1 2-linked and 1 3-linked). Quantification of their effect on endogenous Prat gene expression, using RT-PCR in young adult fly heads, identifies a subset of modifiers that are candidates for genes involved in regulating Prat expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,496

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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