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Enregistrement W1949586203 · doi:10.1139/b11-099

Two distinct pathways for iron acquisition by iron-limited cyanobacterial cells: evidence from experiments using siderophores and synthetic chelators

2012· article· en· W1949586203 sur OpenAlexaffvenue
Mathew B. Sonier, Daniel Contreras, Ron G. Treble, Harold G. Weger

Notice bibliographique

RevueBotany · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSiderophoreBiologyPeriplasmic spaceChelationCyanobacteriaBiochemistryDeferoxamineFerritinMicrobiologyBacteriaChemistryEscherichia coliInorganic chemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Iron-limited cyanobacterial cells are generally considered to acquire extracellular iron through a siderophore-dependent system, although evidence has started to accumulate that other, as yet poorly characterized, iron acquisition systems may also play a role. Iron-limited cells of the cyanobacterium Anabaena flos-aquae (Lyng.) Brèb. are well known to produce the relatively low Fe(III) affinity dihydroxamate siderophore schizokinen. In this set of experiments we show that iron-limited A. flos-aquae cells (i) acquired iron at substantial rates in the absence of the schizokinen and (ii) acquired iron from a bacterial siderophore (the trihydroxamate molecule desferrioxamine B (DFB)), and also a synthetic chelator (N, N-bis(2-(bis(carboxymethyl)amino)ethyl)glycine (DTPA)), with substantially higher affinities for Fe(III) than schizokinen, indicating that a schizokinen-independent iron acquisition pathway was operating. We suggest that there exists a siderophore-independent iron acquisition system that is able to acquire Fe(III) from high stability Fe(III)-chelates, which are not accessible to iron-limited cells via the schizokinen-based system. As well, we present two possible models for iron acquisition by iron-limited A. flos-aquae cells. Both of these models suggest that there are two major routes for Fe(III) entry into the periplasm of iron-limited cells: (1) the well-characterized siderophore (schizokinen) dependent process and (2) a siderophore-independent process that is able to access Fe(III) sources not biologically available to the schizokinen system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,787

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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