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Enregistrement W1950002291 · doi:10.1111/j.1747-0285.2011.01150.x

Comprehensive Analysis of Single‐ and Multi‐Target Activity Cliffs Formed by Currently Available Bioactive Compounds

2011· article· en· W1950002291 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueChemical Biology & Drug Design · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensEmergent BioSolutions (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryPotencyComputational biologyComputer scienceBiologyBiochemistryIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Activity cliffs are formed by structurally similar compounds having large potency differences. Their study is a focal point of SAR analysis. We present a first systematic survey of single- and multitarget activity cliffs contained in currently available bioactive compounds. Approximately 12% of all active compounds were involved in the formation of activity cliffs. Perhaps unexpectedly, activity cliffs were found to be similarly distributed over different protein target families. Moreover, only approximately 5% of all activity cliffs were multitarget cliffs. Importantly, we also found that only very few multitarget cliffs were formed by compounds having different target selectivity. In addition, 'polypharmacological cliffs', i.e., multitarget activity cliffs involving targets from different protein families, were also only rarely found. Taken together, our findings reveal that only approximately 2% of all pairs of structurally similar compounds sharing the same biological activity form activity cliffs but that, on average, approximately one of 10 active compounds is involved in the formation of one or two single-target cliffs of large magnitude (with at least 100-fold difference in potency). These compounds provide a rich source of SAR information and can be identified across many different target families.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,432
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle