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Enregistrement W1950624415 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-2488

Abstract 2488: Analysis of the salivary proteome of the prolactin-inducible-protein knockout mouse

2014· article· en· W1950624415 sur OpenAlexaff
Anne Blanchard, Peyman Ezzati, Xiuli Ma, John Wilkins, Yvonne Myal

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSalivary Gland Disorders and Functions
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalivaProteomeBiologyKnockout mouseImmune systemTranscriptomeS100A9ProteomicsImmunologySalivary glandReceptorMolecular biologyGeneInflammationGene expressionGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The human Prolactin-Inducible-Protein (PIP)/Gross Cystic Disease Fluid Protein 15 (GCDFP-15) gene is abnormally expressed in human invasive breast cancer and gross cystic disease of the breast. In healthy individuals PIP is highly expressed in salivary, sweat and lacrimal glands, and the secreted protein abundantly found in saliva as well as other bodily fluids which bathe various ports of entry. PIP has been shown to bind numerous bacterial strains as well as a number of immunoregulatory molecules including the CD4-T cell receptor and IgG and is therefore implicated to play an immune role in host defense. In the present study we interrogated the salivary proteome of the PIP knockout (Pip KO) mouse by mass spectrometry to determine protein changes that occur in saliva in the absence of PIP. Proteomic analysis identified 165 proteins in the mouse saliva which had a minimum of 2 unique peptides at the 99% confidence level. Nineteen proteins, including 2 proposed markers of disease, S100A9 and adenosine deaminase, were significantly differentially expressed in the saliva of the Pip KO mouse, compared to the saliva of the wild type counterparts. Functional and biological determinations revealed that the differentially expressed proteins were associated with processes that include inflammatory responses, immunity and cell death. This study provides evidence that a number of proteins associated with host defense are affected by the loss of PIP, and lends support for an immunomodulatory role for PIP. Citation Format: Anne Blanchard, Peyman Ezzati, Xiuli Ma, John Wilkins, Yvonne Myal. Analysis of the salivary proteome of the prolactin-inducible-protein knockout mouse. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 2488. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-2488

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,493
Score d'incertitude au seuil0,737

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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Résumé présentoui

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