Properties of the major non-specific endonuclease from the strict anaerobe Fibrobacter succinogenes and evidence for disulfide bond formation in vivo
Notice bibliographique
Résumé
DNase A is a non-specific endonuclease of Fibrobacter succinogenes. The enzyme was purified to homogeneity and its properties studied both in vitro and in vivo. Magnesium but not calcium was essential for nucleolytic activity. Manganese ions substituted for magnesium but were less stimulatory. DNase A activity was markedly inhibited by either NaCl or KCl at concentrations greater than 75 mM. The enzyme had a temperature optimum of 25 degrees C and a pH optimum of about 7.0. Values for K:(m) and K:(cat) were determined to be 61 microM and 330 s(-1) respectively, with a catalytic efficiency approximately threefold greater than bovine pancreatic DNase I, but 10-fold less than the Serratia marcescens NucA. DNase A was localized to the periplasm and probably exists as a monomeric species. The enzyme possessed one or more disulfide bonds. In the reduced form it had an apparent mass of 33 kDa, while in the oxidized form it was 29 kDa as estimated by SDS-PAGE. Reduction of the disulfide bonds by dithiothreitol with or without subsequent alkylation by iodoacetamide strongly inactivated the enzyme. DNase A accumulated in vivo had an apparent mass of 29 kDa, indicating that it was in an oxidized form. This is the first indication in a strict anaerobe of a functional periplasmic disulfide bond forming system, phenotypically similar to Dsb systems in facultative and aerobic bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».