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Enregistrement W1951724000 · doi:10.18637/jss.v067.i01

Fitting Linear Mixed-Effects Models Using <b>lme4</b>

2015· article· en· W1951724000 sur OpenAlexafffund
Douglas M. Bates, Martin Mächler, Benjamin M. Bolker, Steve Walker

Notice bibliographique

RevueJournal of Statistical Software · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueData Analysis with R
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBanff International Research Station for Mathematical Innovation and Discovery
Mots-clésRestricted maximum likelihoodDeviance (statistics)Mixed modelSmoothingApplied mathematicsLikelihood functionMathematicsGeneralized linear modelLinear modelMaximum likelihoodGeneralized linear mixed modelCovariateAlgorithmStatisticsMathematical optimizationComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Maximum likelihood or restricted maximum likelihood (REML) estimates of the parameters in linear mixed-effects models can be determined using the lmer function in the lme4 package for R. As for most model-fitting functions in R, the model is described in an lmer call by a formula, in this case including both fixed- and random-effects terms. The formula and data together determine a numerical representation of the model from which the profiled deviance or the profiled REML criterion can be evaluated as a function of some of the model parameters. The appropriate criterion is optimized, using one of the constrained optimization functions in R, to provide the parameter estimates. We describe the structure of the model, the steps in evaluating the profiled deviance or REML criterion, and the structure of classes or types that represents such a model. Sufficient detail is included to allow specialization of these structures by users who wish to write functions to fit specialized linear mixed models, such as models incorporating pedigrees or smoothing splines, that are not easily expressible in the formula language used by lmer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,038
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,095
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,104
Score d'incertitude au seuil0,346

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0380,095
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0060,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,010
Bibliométrie0,0040,006
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0080,004
Intégrité de la recherche0,0040,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1040,048

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85 618
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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