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Enregistrement W1951829736 · doi:10.1111/j.1365-2559.2011.03896.x

Development and evaluation of a robust algorithm for computer-assisted detection of sentinel lymph node micrometastases

2011· article· en· W1951829736 sur OpenAlexaff
G. Clarke, Chris Peressotti, Claire Holloway, Judit Zubovits, Kela Liu, Martin J. Yaffe

Notice bibliographique

RevueHistopathology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensUniversity of TorontoHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrometastasisSentinel lymph nodeLymphLymph nodeMedicinePathologyRadiologyNuclear medicineBreast cancerCancerInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: Increasing the sectioning rate for breast sentinel lymph nodes can increase the likelihood of detecting micrometastases. To make serial sectioning feasible, we have developed an algorithm for computer-assisted detection (CAD) with digitized lymph node sections. METHODS AND RESULTS: K-means clustering assigned image pixels to one of four areas in a colourspace (representing tumour, unstained background, counterstained background and microtomy artefacts). Four filters then removed 'false-positive' pixels from the tumour cluster. A set of 43 sections containing tumour (a total of 259 foci) and 59 sections negative for malignancy was defined by two pathologists, using light microscopy, and CAD was applied. For the clinically relevant task of identifying the largest focus in each section (micrometastasis in 22/43 sections), the sensitivity and specificity were 100%. Isolated tumour cells (ITCs) were identified in one slide initially considered to be negative. Identification of all 259 foci yielded sensitivities of 57.5% for ITCs (<0.200 mm), 89.5% for micrometastases, and 100% for larger metastases, with one false-positive. Reduced sensitivity was ascribed to variable staining. Nine additional metastases (<0.01-0.3 mm) that were not initially identified were detected by CAD. CONCLUSIONS: This algorithm is well suited to the task of sentinel lymph node evaluation and may enhance the detection of occult micrometastases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,925
Score d'incertitude au seuil0,416

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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