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Enregistrement W1951987747

Genetic epidemiology of ankylosing spondylitis

2006· dissertation· en· W1951987747 sur OpenAlexaboutno aff
Tara Snelgrove

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2006
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSpondyloarthritis Studies and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCandidate geneLinkage disequilibriumTransmission disequilibrium testMinor allele frequencyGeneticsPopulationAnkylosing spondylitisMedicineGenetic associationSingle-nucleotide polymorphismBiologyGenotypeInternal medicineGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Ankylosing spondylitis (AS) is a chronic inflammatory arthritis and represents the most common seronegative spondyloarthropathy with an approximate prevalence of one in one thousand Caucasians. Clinically, AS commonly presents as a predominantly axial arthritis affecting the spine and girdle joints. AS is a complex genetic disease with multiple susceptibility factors. Though it is known AS susceptibility has a strong genetic component, with a sibling recurrence risk (λs) of 82, the majority of the susceptibility genes are unidentified. -- Objective: The objective of this study was to identify and test potential candidate genes for susceptibility to AS in the Newfoundland population. Candidate genes were chosen based on functional relevance to disease phenotype or on positional proximity to known chromosome regions of linkage to AS. -- Methods: All patients with AS met the modified New York Criteria and the controls were ethnically matched. A Newfoundland cohort of 101 AS patients and 103 ethnically matched controls were genotyped using the Sequenom MassArray platform. All controls met Hardy Weinberg equilibrium. Analysis was performed using appropriate statistical tests. -- Results: The minor allele frequencies for the candidate genes TLR4 Asp299Gly (Pc=0.05) and TNFα promoter polymorphisms -308 (Pc=0.008), -863/-1031 (in linkage disequilibrium Pc=0.000) were found to be associated with AS. Other candidate genes tested showed no association with disease. Minor alleles of the single nucleotide polymorphisms chosen for the candidate genes FGFR2, TCIRG1, and DLL3 were not present in the Newfoundland population. No secondary associations of phenotype and genotype were noted for disease severity indices, gender or age of onset. -- Conclusion: A novel association was noted between TLR4 and AS and the association of promoter polymorphisms of TNFα was validated in the Newfoundland population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,082
Score d'incertitude au seuil0,163

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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