Highlights of the Third Annual Biomarker World Congress: biomarkers for molecular diagnostics
Notice bibliographique
Résumé
With the proliferation of high-content profiling technologies available for analyzing genetic, transcriptomic, proteomic and metabolomic markers in tissues, both novel analytes and increasingly complex signatures are emerging as biomarkers supporting drug development. If prospective studies during the course of clinical development support the clinical utility of a biomarker, consideration may eventually be given to converting such research-use only biomarker assays into medical diagnostics. The present report briefly summarizes a selected set of presentations geared towards the issues and principles involved in the validation of biomarkers for use as molecular diagnostics, as presented at the Third Annual Biomarker World Congress held in Philadelphia, Pennsylvania on 15 - 18 May 2007. More than 400 delegates attended the Third Annual Biomarker World Congress to discuss the role of biomarkers in all phases of drug discovery and development. The main conference consisted of four tracks addressing issues involving: i) biomarkers in early drug development; ii) biomarkers in clinical development; iii) biomarkers for molecular diagnostics; and iv) biomarker assay development. The present review focuses on selected presentations of relevance to the third track. Topics covered by the speakers included biomarker assays that seem to have diagnostic and/or theranostic potential in a variety of therapeutic settings and disease indications. Themes included both the general and specific issues that can be encountered when attempting to convert a biomarker assay into a molecular diagnostic for use in the clinical setting.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,008 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,018 | 0,007 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».