A Genome‐Wide Association Study for Venous Thromboembolism: The Extended Cohorts for Heart and Aging Research in Genomic Epidemiology (CHARGE) Consortium

2013· article· en· 124 citations· W1953169434 sur OpenAlex· 10.1002/gepi.21731

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Prédiction distillée sur la base complète

Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

Catégories candidates: Métarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuelles: aucune
Domaine: Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
Devis d'étude: Signal candidat: ObservationnelSignal consensuel: Observationnel
Genre: Signal candidat: EmpiriqueSignal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants: 0,030
Score d'incertitude au seuil: 1,000
Statut de validation: machine_predicted_unvalidated · codex-gemma-dda1882f352a

Scores Codex et Gemma par catégorie

Catégorie	Codex	Gemma
Métarecherche	0,017	0,020
Méta-épidémiologie (sens strict)	0,000	0,000
Méta-épidémiologie (sens large)	0,001	0,000
Bibliométrie	0,000	0,000
Études des sciences et des technologies	0,001	0,000
Communication savante	0,000	0,000
Science ouverte	0,000	0,000
Intégrité de la recherche	0,001	0,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)	0,000	0,000

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,067

Tête enseignante GPT0,373

Écart entre enseignants: 0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation: score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Venous thromboembolism (VTE) is a common, heritable disease resulting in high rates of hospitalization and mortality. Yet few associations between VTE and genetic variants, all in the coagulation pathway, have been established. To identify additional genetic determinants of VTE, we conducted a two-stage genome-wide association study (GWAS) among individuals of European ancestry in the extended cohorts for heart and aging research in genomic epidemiology (CHARGE) VTE consortium. The discovery GWAS comprised 1,618 incident VTE cases out of 44,499 participants from six community-based studies. Genotypes for genome-wide single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were imputed to approximately 2.5 million SNPs in HapMap and association with VTE assessed using study-design appropriate regression methods. Meta-analysis of these results identified two known loci, in F5 and ABO. Top 1,047 tag SNPs (P ≤ 0.0016) from the discovery GWAS were tested for association in an additional 3,231 cases and 3,536 controls from three case-control studies. In the combined data from these two stages, additional genome-wide significant associations were observed on 4q35 at F11 (top SNP rs4253399, intronic to F11) and on 4q28 at FGG (rs6536024, 9.7 kb from FGG; P < 5.0 × 10(-13) for both). The associations at the FGG locus were not completely explained by previously reported variants. Loci at or near SUSD1 and OTUD7A showed borderline yet novel associations (P < 5.0 × 10(-6) ) and constitute new candidate genes. In conclusion, this large GWAS replicated key genetic associations in F5 and ABO, and confirmed the importance of F11 and FGG loci for VTE. Future studies are warranted to better characterize the associations with F11 and FGG and to replicate the new candidate associations.

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La notice

Revue: Genetic Epidemiology
Thématique: Genetic Associations and Epidemiology
Domaine: Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens: McMaster University
Organismes subventionnaires: National Center for Advancing Translational SciencesNational Center for Research ResourcesNational Human Genome Research InstituteNational Cancer InstituteNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingCenters for Disease Control and Prevention
Mots-clés: Genome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismInternational HapMap ProjectGenetic associationGeneticsSNPBiologyGenetic epidemiologyABO blood group systemMedicineGenotypeGene
Résumé présent dans OpenAlex: oui
API: /api/v1/works/W1953169434