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Enregistrement W1953898917 · doi:10.4049/jimmunol.1400961

Expansion of Dysfunctional Tim-3–Expressing Effector Memory CD8+ T Cells during Simian Immunodeficiency Virus Infection in Rhesus Macaques

2014· article· en· W1953898917 sur OpenAlexaff
Tsuyoshi Fujita, Benjamin J. Burwitz, Glen M. Chew, Jason S. Reed, Reesab Pathak, Elizabeth Seger, Kiera Clayton, James M. Rini, Mario Ostrowski, Naoto Ishii, Marcelo J. Kuroda, Scott G. Hansen, Jonah B. Sacha, Lishomwa C. Ndhlovu

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesCenter for AIDS Research, University of WashingtonNational Institutes of HealthInternational AIDS SocietyU.S. Public Health ServiceSilver Family FoundationOffice of AIDS ResearchNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesDelaney AIDS Research Enterprise
Mots-clésSimian immunodeficiency virusEffectorVirologyDysfunctional familyBiologyCD8ImmunodeficiencySimianCytotoxic T cellHuman immunodeficiency virus (HIV)ImmunologyVirusImmune systemMedicineGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The T cell Ig- and mucin domain-containing molecule-3 (Tim-3) negative immune checkpoint receptor demarcates functionally exhausted CD8(+) T cells arising from chronic stimulation in viral infections like HIV. Tim-3 blockade leads to improved antiviral CD8(+) T cell responses in vitro and, therefore, represents a novel intervention strategy to restore T cell function in vivo and protect from disease progression. However, the Tim-3 pathway in the physiologically relevant rhesus macaque SIV model of AIDS remains uncharacterized. We report that Tim-3(+)CD8(+) T cell frequencies are significantly increased in lymph nodes, but not in peripheral blood, in SIV-infected animals. Tim-3(+)PD-1(+)CD8(+) T cells are similarly increased during SIV infection and positively correlate with SIV plasma viremia. Tim-3 expression was found primarily on effector memory CD8(+) T cells in all tissues examined. Tim-3(+)CD8(+) T cells have lower Ki-67 content and minimal cytokine responses to SIV compared with Tim-3(-)CD8(+) T cells. During acute-phase SIV replication, Tim-3 expression peaked on SIV-specific CD8(+) T cells by 2 wk postinfection and then rapidly diminished, irrespective of mutational escape of cognate Ag, suggesting non-TCR-driven mechanisms for Tim-3 expression. Thus, rhesus Tim-3 in SIV infection partially mimics human Tim-3 in HIV infection and may serve as a novel model for targeted studies focused on rejuvenating HIV-specific CD8(+) T cell responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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