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Enregistrement W195762043 · doi:10.1096/fasebj.21.5.a120-d

Reduced Expression and Methylation of Soat2 in Liver From Mice with Hyperhomocysteinemia.

2007· article· en· W195762043 sur OpenAlexaff
Angela M. Devlin, Ranji Singh, Rachel E Wade, Heather Boersma, Sheila M. Innis

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCystathionine beta synthaseHyperhomocysteinemiaMethylationInternal medicineEndocrinologyMethionineSterol O-acyltransferaseHomocysteineCholesterolDNA methylationBiologyChemistryMethionine synthaseMethylenetetrahydrofolate reductaseGene expressionBiochemistryGeneLipoproteinAmino acidAlleleMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hyperhomocysteinemia (HHcy) is associated with alterations in liver lipid metabolism and this may contribute to the pathological effects of HHcy. The goal of this study was to determine if HHcy is associated with changes in liver cholesterol ester fatty acids and expression and methylation of the Soat2 gene. Soat2 encodes acyl‐coenzyme A:cholesterol acyltransferase 2 (ACAT2), which functions to catalyze the reaction responsible for the intracellular esterification of cholesterol with acyl‐CoA molecules, with oleoyl‐CoA the preferred substrate. Mice heterozygous for disruption of the gene for cystathionine‐(‐synthase (Cbs +/−) and C57BL/6 mice (Cbs +/+) were fed a control diet or a high methionine/low folate (HH) diet to induce HHcy. Levels of Soat2 mRNA (p<0.05) and ACAT protein (p<0.001) in liver were lower in Cbs +/− mice fed the HH diet with higher plasma total homocysteine levels than Cbs +/+ mice fed the control diet (35.01±5.6 vs 2.21±0.6 (M, respectively). Given we have previously shown that HHcy is accompanied by reduced tissue methylation capacity and changes in gene‐specific DNA methylation, we determined the methylation status of Soat2. In silico searches identified a CpG‐rich region in the 5′ upstream portion of the Soat2 gene and found that this region was 50% less methylated in Cbs +/− mice fed the HH diet than in Cbs +/+ mice fed the control diet. Total levels of cholesterol ester in liver were not different in mice with HHcy but levels of oleic acid were lower (p<0.05) in cholesterol esters from Cbs+/− mice fed the HH diet than Cbs+/+ mice fed the control diet. These findings are the first to show reduced methylation and expression of the Soat2 gene in a mouse model of HHcy and suggest role for changes in liver cholesterol ester metabolism in the pathology of HHcy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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