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Enregistrement W1957639824 · doi:10.29173/eureka8021

Immobilized artificial membrane (IAM) liquid chromatography as a model for antimicrobial peptide partitioning into cell membranes: An evaluation

2010· article· en· W1957639824 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueEureka · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMembraneCovalent bondChemistryChromatographyAntimicrobial peptidesPeptidePhosphatidylcholineLipid bilayerAcetonitrileElutionPhospholipidOrganic chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Non-covalent immobilized artificial membrane reverse-phase high performance liquid chromatography was previously evaluated as a means whereby elution times for antimicrobial peptides from columns mimicking the lipid bilayers of different membrane systems might be used as a fast-screening method to compare relative binding effectiveness. Such a system would aid in the development of antimicrobial peptides that bind preferentially to model pathogenic systems and leave the host’s membranes reasonably unaffected. A non-covalent approach allows for flexibility in membrane composition but was found to be inadequate for analysis of most peptides due to significant lipid loss at high acetonitrile concentrations. A covalent approach where phosphatidylcholine was amide-linked to the silica surface was examined to evaluate its use as a fast-screening method and compare its data to that collected from the non-covalent columns. Initial work with a 1-cm column proved ineffective due to problems with balancing flow rates with retention times, and work was shifted to a longer 10-cm column. Results suggested that peptides bind much more strongly to covalent columns than non-covalent ones, with the binding especially enhanced by the presence of cationic residues. These columns had lipid packing densities much lower than true membranes, indicating that the peptides were partitioning deep into the bonded phase of the columns rather than into the interfacial region of the phosphate head groups, as expected in situations of biologically-relevant lipid packing densities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle