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Enregistrement W195843954 · doi:10.1096/fasebj.21.6.lb69

Association of AMP kinase β <sub>2</sub> subunit with glycogen particles as revealed by immunoelectron microscopy

2007· article· en· W195843954 sur OpenAlexaff
Moı̈se Bendayan, Irene Londoño, Diane Gingras, Neil B. Ruderman, Marc Prentki

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunoelectron microscopyImmunogold labellingGlycogenEndoplasmic reticulumProtein subunitCell biologyImmunolabelingAMPKBiologyProtein kinase ABiochemistryChemistryKinaseUltrastructureImmunohistochemistryAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AMP kinase β 2 subunit contains a functional glycogen binding domain (β‐GBD) that links AMPK to glycogen metabolism. By routine electron microscopy, glycogen deposits in cells are easily visualized as small rosettes of dark granules. However, immunocytochemistry requires weak fixation protocols that allow preservation of protein antigenicity but have the drawback of preventing retention of certain cellular elements such as glycogen. The cells thus appear vacuolated. Immunogold for AMPK subunits on such tissues leads to specific labelings located only in cytoplasmic areas surrounding the endoplasmic reticulum. We herein report the development of a new protocol for immunoelectron microscopy that retains glycogen deposits within the cells with the possibility of performing successfully the immunolabeling for the AMPK subunits. Upon applying specific antibodies against the various AMPK subunits on rat liver tissue, quantitative immunogold revealed that the labeling for the β 2 subunit is closely associated, for its very large majority, with the glycogen particles of the cell. The other subunits, α 1 and α 2 , are more abundant in cytoplasmic areas close to the endoplasmic reticulum and mitochondria. These results demonstrate the existence of a structural link between AMPK β 2 subunit and glycogen, a major energy store of the cell.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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