The N‐terminal amphipathic region of the <i>Escherichia coli</i> type III secretion system protein EspD is required for membrane insertion and function
Notice bibliographique
Résumé
Enterohemorrhagic Escherichia coli is a causative agent of gastrointestinal and diarrheal diseases. These pathogenic E. coli express a syringe-like protein machine, known as the type III secretion system (T3SS), used for the injection of virulence factors into the cytosol of the host epithelial cell. Breaching the epithelial plasma membrane requires formation of a translocation pore that contains the secreted protein EspD. Here we demonstrate that the N-terminal segment of EspD, encompassing residues 1-171, contains two amphipathic domains spanning residues 24-41 and 66-83, with the latter of these helices being critical for EspD function. Fluorescence and circular dichroism analysis revealed that, in solution, His₆-EspD₁₋₁₇₁ adopts a native disordered structure; however, on binding anionic small unilamellar vesicles composed of phosphatidylserine, His₆-EspD₁₋₁₇₁ undergoes a pH depended conformational change that increases the α-helix content of this protein approximately sevenfold. This change coincides with insertion of the region circumscribing Trp₄₇ into the hydrophobic core of the lipid bilayer. On the HeLa cell plasma membrane, His₆-EspD₁₋₁₇₁ forms a homodimer that is postulated to promote EspD-EspD oligomerization and pore formation. Complementation of ΔespD null mutant bacteria with an espDΔ66-83 gene showed that this protein was secreted but non-functional.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».