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Enregistrement W1959027256 · doi:10.1186/s12885-015-1468-6

Menacalc, a quantitative method of metastasis assessment, as a prognostic marker for axillary node-negative breast cancer

2015· article· en· W1959027256 sur OpenAlexafffund
Catherine L. Forse, Seema Agarwal, Dushanthi Pinnaduwage, Frank B. Gertler, John S. Condeelis, Juan Lin, Xiaonan Xue, Kimberly L. Johung, Anna Marie Mulligan, Thomas E. Rohan, Shelley B. Bull, Irene L. Andrulis

Notice bibliographique

RevueBMC Cancer · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensUniversity Health NetworkLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBreast cancerMedicineOncologyHazard ratioInternal medicineProportional hazards modelSurgical oncologyBiomarkerCancerPopulationSurvival analysisConfidence intervalBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Menacalc is an immunofluorescence-based, quantitative method in which expression of the non-invasive Mena protein isoform (Mena11a) is subtracted from total Mena protein expression. Previous work has found a significant positive association between Menacalc and risk of death from breast cancer. Our goal was to determine if Menacalc could be used as an independent prognostic marker for axillary node-negative (ANN) breast cancer. METHODS: Analysis of the association of Menacalc with overall survival (death from any cause) was performed for 403 ANN tumors using Kaplan Meier survival curves and the univariate Cox proportional hazards (PH) model with the log-rank or the likelihood ratio test. Cox PH models were used to estimate hazard ratios (HRs) for the association of Menacalc with risk of death after adjustment for HER2 status and clinicopathological tumor features. RESULTS: High Menacalc was associated with increased risk of death from any cause (P=0.0199, HR (CI)=2.18 (1.19, 4.00)). A similarly elevated risk of death was found in the subset of the Menacalc cohort which did not receive hormone or chemotherapy (n=142) (P=0.0052, HR (CI)=3.80 (1.58, 9.97)). There was a trend toward increased risk of death with relatively high Menacalc in the HER2, basal and luminal molecular subtypes. CONCLUSIONS: Menacalc may serve as an independent prognostic biomarker for the ANN breast cancer patient population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,135
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,408
Écart entre enseignants0,353 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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