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Enregistrement W1960200814 · doi:10.1186/s12936-015-0823-z

Glucose-6-phosphate dehydrogenase deficiency among malaria patients of Honduras: a descriptive study of archival blood samples

2015· article· en· W1960200814 sur OpenAlexaff
Miguel A. Zúñiga, Rosa Elena Mejía, Ana Sánchez, Wilfredo Sosa‐Ochoa, Gustavo Fontecha

Notice bibliographique

RevueMalaria Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Health and Biochemistry
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesUniversidad Nacional Autonoma de Honduras
Mots-clésPrimaquineMalariaPlasmodium vivaxGlucose-6-phosphate dehydrogenase deficiencyPlasmodium falciparumParasitologyGenotypeBiologyGlucosephosphate Dehydrogenase DeficiencyChloroquineAllele frequencyPlasmodium ovaleVirologyMedicineInternal medicineImmunologyGlucose-6-phosphate dehydrogenaseGeneticsDehydrogenaseGeneZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The frequency of deficient variants of glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PDd) is particularly high in areas where malaria is endemic. The administration of antirelapse drugs, such as primaquine, has the potential to trigger an oxidative event in G6PD-deficient individuals. According to Honduras´ national scheme, malaria treatment requires the administration of chloroquine and primaquine for both Plasmodium vivax and Plasmodium falciparum infections. The present study aimed at investigating for the first time in Honduras the frequency of the two most common G6PDd variants. METHODS: This was a descriptive study utilizing 398 archival DNA samples of patients that had been diagnosed with malaria due to P. vivax, P. falciparum, or both. The most common allelic variants of G6PD: G6PD A+(376G) and G6PD A-(376G/202A) were assessed by two molecular methods (PCR-RFLP and a commercial kit). RESULTS: The overall frequency of G6PD deficient genotypes was 16.08%. The frequency of the "African" genotype A- (Class III) was 11.9% (4.1% A- hemizygous males; 1.5% homozygous A- females; and 6.3% heterozygous A- females). A high frequency of G6PDd alleles was observed in samples from malaria patients residing in endemic regions of Northern Honduras. One case of Santamaria mutation (376G/542T) was detected. CONCLUSIONS: Compared to other studies in the Americas, as well as to data from predictive models, the present study identified a higher-than expected frequency of genotype A- in Honduras. Considering that the national standard of malaria treatment in the country includes primaquine, further research is necessary to ascertain the risk of PQ-triggered haemolytic reactions in sectors of the population more likely to carry G6PD mutations. Additionally, consideration should be given to utilizing point of care technologies to detect this genetic disorder prior administration of 8-aminoquinoline drugs, either primaquine or any new drug available in the near future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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