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Enregistrement W1960702130 · doi:10.1111/j.1365-2761.2011.01280.x

Virion glycosylation governs integrity and infectivity of infectious pancreatic necrosis virus

2011· article· en· W1960702130 sur OpenAlexaff
Helena Fridholm, Einar Everitt

Notice bibliographique

RevueJournal of Fish Diseases · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesVetenskapsrådetCrafoordska StiftelsenSvenska Forskningsrådet Formas
Mots-clésInfectivityBiologyGlycosylationVirusInfectious pancreatic necrosis virusVirologyEnzymeCapsidTrypsinBiochemistryMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The possible importance of the O-linked glycosylation in virion stability and infectivity of infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) was analysed. Enzymatic treatment with O-glycosidase of radiolabelled virions under different ionic conditions, to allow for possible alternative exposure of glycosidic enzyme cleavage sites, did not alter the specific infectivity of virions re-isolated after rate-zonal centrifugation in glycerol gradients. As an alternative method to assess the significance of carbohydrates in IPNV integrity, periodate oxidation in the presence of an aldehyde quencher was chosen. Following re-isolation of viruses, a 3-5 (10)log-unit reduction in specific infectivity was revealed and, at higher concentrations, a total disruption or virion aggregation was observed. The loss of infectivity of intact virions was not because of a lack of attachment to cells. Additionally, re-evaluation of reading values from UV-spectra of purified IPNV yielded a specific infectivity of 3 × 10(11) TCID(50)-units mg(-1) of protein and a ratio of 40 virions per TCID(50)-unit in the CHSE-214 cell system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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