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Enregistrement W1962540238 · doi:10.1111/j.1365-2958.2004.04215.x

The sirodesmin biosynthetic gene cluster of the plant pathogenic fungus <i>Leptosphaeria maculans</i>

2004· article· en· W1962540238 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesGrains Research and Development Corporation
Mots-clésLeptosphaeria maculansBiologyMagnaporthe griseaGene clusterPhytotoxinGliotoxinGeneBlacklegGeneticsFungusAspergillus fumigatusCoronatinePathogenic fungusGenomeMicrobiologyBotanyArabidopsisBrassicaOryza sativaToxin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sirodesmin PL is a phytotoxin produced by the fungus Leptosphaeria maculans, which causes blackleg disease of canola (Brassica napus). This phytotoxin belongs to the epipolythiodioxopiperazine (ETP) class of toxins produced by fungi including mammalian and plant pathogens. We report the cloning of a cluster of genes with predicted roles in the biosynthesis of sirodesmin PL and show via gene disruption that one of these genes (encoding a two-module non-ribosomal peptide synthetase) is essential for sirodesmin PL biosynthesis. Of the nine genes in the cluster tested, all are co-regulated with the production of sirodesmin PL in culture. A similar cluster is present in the genome of the opportunistic human pathogen Aspergillus fumigatus and is most likely responsible for the production of gliotoxin, which is also an ETP. Homologues of the genes in the cluster were also identified in expressed sequence tags of the ETP producing fungus Chaetomium globosum. Two other fungi with publicly available genome sequences, Magnaporthe grisea and Fusarium graminearum, had similar gene clusters. A comparative analysis of all four clusters is presented. This is the first report of the genes responsible for the biosynthesis of an ETP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,258

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,179
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle