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Enregistrement W1962561849 · doi:10.1111/tpj.12904

A precise spacing between the <scp>NPA</scp> domains of aquaporins is essential for silicon permeability in plants

2015· article· en· W1962561849 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSilicon Effects in Agriculture
Établissements canadiensHôtel-Dieu de QuébecUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanada Research Chairs
Mots-clésAquaporinPermeability (electromagnetism)ChemistrySiliconCell biologyBiologyBiochemistryMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The controversy surrounding silicon (Si) benefits and essentiality in plants is exacerbated by the differential ability of species to absorb this element. This property is seemingly enhanced in species carrying specific nodulin 26-like intrinsic proteins (NIPs), a subclass of aquaporins. In this work, our aim was to characterize plant aquaporins to define the features that confer Si permeability. Through comparative analysis of 985 aquaporins in 25 species with differing abilities to absorb Si, we were able to predict 30 Si transporters and discovered that Si absorption is exclusively confined to species that possess NIP-III aquaporins with a GSGR selectivity filter and a precise distance of 108 amino acids (AA) between the asparagine-proline-alanine (NPA) domains. The latter feature is of particular significance since it had never been reported to be essential for Si selectivity. Functionality assessed in the Xenopus oocyte expression system showed that NIPs with 108 AA spacing exhibited Si permeability, while proteins differing in that distance did not. In subsequent functional studies, a Si transporter from poplar mutated into variants with 109- or 107-AA spacing failed to import, and a tomato NIP gene mutated from 109 to 108 AA exhibited a rare gain of function. These results provide a precise molecular basis to classify higher plants into Si accumulators or excluders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,408
Score d'incertitude au seuil0,198

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle