Autophagy is active in normal colon mucosa
Notice bibliographique
Résumé
Recently, autophagy has been found to be strongly activated in colon cancer cells, but few studies have addressed the normal colon mucosa. The aim of this study was to characterize autophagy in normal human intestinal cells. We used the expression of LC3-II and BECN1 as well as SQSTM1 as markers of autophagy activity. Using the normal human intestinal epithelial crypt (HIEC) cell experimental model, we found that autophagy was much more active in undifferentiated cells than in differentiated cells. In the normal adult colonic mucosa, BECN1 was found in the proliferative epithelial cells of the lower part of the gland while SQSTM1 was predominantly found in the differentiated cells of the upper part of the gland and surface epithelium. Interestingly, the weak punctate pattern of SQSTM1 expression in the lower gland colocalized with BECN1-labeled autophagosomes. The usefulness of SQSTM1 as an active autophagy marker was confirmed in colon cancer specimens at the protein and transcript levels. In conclusion, our results show that autophagy is active in the colonic gland and is associated with the intestinal proliferative/undifferentiated and progenitor cell populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».