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Enregistrement W1963586335 · doi:10.1074/jbc.m008423200

Identification of a Heparin Binding Domain in the N-terminal Cleavage Site of Pro-islet Amyloid Polypeptide

2001· article· en· W1963586335 sur OpenAlexafffund
Kirily Park, C. Bruce Verchere

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaChildren's & Women's Health Centre of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchMedical Research Council Canada
Mots-clésIsletCleavage (geology)Terminal (telecommunication)Binding siteIdentification (biology)ChemistryPolypeptide chainDomain (mathematical analysis)BiochemistryAmyloid (mycology)Cell biologyMolecular biologyBiologyEndocrinologyComputer scienceAmino acidDiabetes mellitus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Islet amyloid deposits are a characteristic pathologic lesion of the pancreas in type 2 diabetes and are composed primarily of the islet beta cell peptide islet amyloid polypeptide (IAPP or amylin) as well as the basement membrane heparan sulfate proteoglycan perlecan. Impaired processing of the IAPP precursor has been implicated in the mechanism of islet amyloid formation. The N- and C-terminal cleavage sites where pro-IAPP is processed by prohormone convertases contain a series of basic amino acid residues that we hypothesized may interact with heparan sulfate proteoglycans. This possibility was tested using affinity chromatography by applying synthetic fragments of pro-IAPP to heparin-agarose and heparan sulfate-Sepharose. An N-terminal human pro-IAPP fragment (residues 1-30) was retained by both heparin-agarose and heparan sulfate-Sepharose, eluting at 0.18 m NaCl at pH 7.5. Substitution of alanine residues for two basic residues in the N-terminal cleavage site abolished heparin and heparan sulfate binding activity. At pH 5.5, the affinity of the wild-type peptide for heparin/heparan sulfate was increased, implying a role for histidine residues at positions 6 and 28 of pro-IAPP. A C-terminal pro-IAPP fragment (residues 41-67) had no specific affinity for either heparin or heparan sulfate, and the N- or C-terminal fragments had only weak affinity for chondroitin sulfate. These data suggest that monomeric N-terminal human pro-IAPP contains a heparin binding domain that is lost during normal processing of pro-IAPP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations101
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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