Limited Genetic Diversity in North American Isolates of<i>Phytophthora erythroseptica</i>Pathogenic to Potato Based on RAPD Analysis
Notice bibliographique
Résumé
Pink rot of potato (Solanum tuberosum), caused by Phytophthora erythroseptica, is found wherever potatoes are grown, and in the last decade, it has reemerged as an economically important disease in Canada and the United States. A selection of isolates of P. erythroseptica from major potato-growing regions in North America, namely Prince Edward Island and New Brunswick, Canada, and Maine and Idaho, U.S.A., was assessed for genetic diversity with randomly chosen decanucleotide primers which were used to amplify regions of DNA to reveal polymorphisms among templates (random amplified polymorphic DNA [RAPD]). The isolates varied in their geographic origin as well as in their sensitivity to mefenoxam, as determined by an in vitro assay. In three separate RAPD screens (I, II, and III) with 23 isolates of P. erythroseptica chosen from a larger collection, 1,410, 369, and 316 robust, scorable bands were amplified, respectively. However, among the bands amplified in screens I, II, and III, only 3, 1, and 3 bands, respectively, were polymorphic. When three primers yielding polymorphisms were used to screen 106 isolates from Prince Edward Island and New Brunswick, or a representative collection of 32 isolates from Prince Edward Island, New Brunswick, Maine, and Idaho, no major variation was discovered. RAPD markers were not correlated with geographic origin or mefenoxam sensitivity of the isolates. From an evolutionary standpoint, the absence of genetic diversity among the isolates of P. erythroseptica we examined may be attributable to the relatively recent introduction of a small founding population of the pathogen in North America.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».