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Enregistrement W1963685438 · doi:10.1371/journal.pone.0042470

Proteomic Profiling of a Mouse Model for Ovarian Granulosa Cell Tumor Identifies VCP as a Highly Sensitive Serum Tumor Marker in Several Human Cancers

2012· article· en· W1963685438 sur OpenAlexafffund
Marie-Noëlle Laguë, Raphaëlle Romieu‐Mourez, Éric Bonneil, Alexandre Boyer, Nicolas Pouletty, Anne‐Marie Mes‐Masson, Pierre Thibault, Marie‐Ève Nadeau, Derek Boerboom

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de MontréalInstitute for Research in Immunology and CancerJewish General HospitalUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentFonds de Recherche du Québec - SantéNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Virginia
Mots-clésBiologyCancer researchOvarian cancerGranulosa cellComputational biologyOvaryCancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The initial aim of this study was to identify novel serum diagnostic markers for the human ovarian granulosa cell tumor (GCT), a tumor that represents up to 5% of all ovarian cancers. To circumvent the paucity of human tissues available for analyses, we used the Ctnnb1(tm1Mmt/+);Pten(tm1Hwu/tmiHwu);Amhr2(tm3(cre)Bhr/+) transgenic mouse model, which features the constitutive activation of CTNNB1 signaling combined with the loss of Pten in granulosa cells and develops GCTs that mimic aggressive forms of the human disease. Proteomic profiling by mass spectrometry showed that vinculin, enolase 1, several heat shock proteins, and valosin containing protein (VCP) were more abundantly secreted by cultured mouse GCT cells compared to primary cultured GC. Among these proteins, only VCP was present in significantly increased levels in the preoperative serum of GCT cancer patients compared to normal subjects. To determine the specificity of VCP, serum levels were also measured in ovarian carcinoma, non-Hodgkin's lymphoma and breast, colon, pancreatic, lung, and prostate cancer patients. Increased serum VCP levels were observed in the majority of cancer cases, with the exception of patients with lung or prostate cancer. Moreover, serum VCP levels were increased in some GCT, ovarian carcinoma, breast cancer, and colon cancer patients who did not otherwise display increased levels of widely used serum tumor markers for their cancer type (e.g. inhibin A, inhibin B, CA125, CEA, or CA15.3). These results demonstrate the potential use of VCP as highly sensitive serum marker for GCT as well as several other human cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,884

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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