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Enregistrement W1963729574 · doi:10.2147/bsam.s46707

Current trends in biobanking for rare diseases: a review

2014· review· en· W1963729574 sur OpenAlexaff
Caroline Graham, Hugh Dawkins, Gareth Baynam, Hanns Lockmuller, Kate Bushby, Lucía Monaco, Kurt Zatloukal, Yaffa Rubinstein, Marina Mora, Bartha Maria Knoppers, Sharon F. Terry, Mats Hansson, Olaf Reiss, Franz Schaefer, David Carpentieri, Domenica Taruscio, Manuel Posada de la Paz, M. Bellgard, Anna Kole, Caron Molster

Notice bibliographique

RevueJournal of Biorepository Science for Applied Medicine · 2014
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University and Génome Québec Innovation CentreMcGill Genome Centre
Organismes subventionnairesEuropean Commission
Mots-clésBiobankDiseaseMedicinePrecision medicineIntensive care medicineBioinformaticsPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract: Rare diseases (RD) refer to a collection of approximately 5,000–8,000 individual diseases that have a low prevalence and are often genetic in origin. While RD can manifest throughout life, they frequently affect children and newborns. Common characteristics include being severe, disabling, life-threatening, degenerative and affecting different organ systems. The burden of RD is often exacerbated by a lack of specific treatments. Whilst there is etiological heterogeneity, there is overlap in cellular and molecular pathways. Amongst specialists, there is legitimate hope that based on genetic knowledge and pathway definition, a new medical classification system, currently called “precision medicine”, will be developed, which may change our view on how to apply shared therapeutic targets. Thus, collection of clinical and genetic data and biospecimens (in biobanks) will play an increasing role in diagnoses and development of therapies for RD. Biobanks are maintained collaboratively by researchers or their institutions, and involve a delicate balance between health policy objectives, academic research, public good outcomes, and community trust. Due to the nature of RD, international cooperation is critical for sharing limited numbers of RD samples and achieving a critical mass. Here we review the current and future direction of RD biobanks and discuss research and development stemming from the use of biospecimens to improve management of RD. Keywords: biobank, biospecimen, rare disease Corrigendum for this paper has ben published

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,969
Score d'incertitude au seuil0,852

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,342 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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