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Enregistrement W1963840734 · doi:10.1139/w04-116

Overproduction and characterization of xylanase B from<i>Aspergillus niger</i>

2005· article· en· W1963840734 sur OpenAlexvenueno aff
Anthony Levasseur, Marcel Asther, Éric Record

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAspergillus nigerXylanaseRecombinant DNABiochemistryMolecular massMolecular biologyComplementary DNAThermostabilityAffinity chromatographyEnzymeBiologyOverproductionChemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The xynB gene, which encodes endo-beta-1,4-xylanase XynB, in Aspergillus niger BRFM281 was amplified by RT-PCR using mRNA isolated from a culture containing sugar beet pulp as an inducer. The cDNA was cloned into an expression cassette under the control of the strong and constitutive glyceraldhehyde-3-phosphate dehydrogenase gene promoter. The expression system was designed to produce the recombinant enzyme XynB with a six-histidine peptide fused to the carboxy end of the protein. Homologous overproduction of XynB was successfully achieved in shake flask cultures, and the secretion yield was estimated to be 900 mg x L(-1). The recombinant XynB was purified 1.5-fold by immobilized metal affinity chromatography to homogeneity using a one-step purification protocol with 71% recovery. The purified recombinant enzyme was fully characterized and has a molecular mass of 23 kDa and an optimal activity at pH 5.5 and 50 degrees C with stability in the pH range 4.0-7.0 and temperature up to 50 degrees C. Using soluble oat spelts xylan, the determined Km and Vmax values were 7.1 mg x mL(-1) and 3881 U x mg(-1), respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,394
Score d'incertitude au seuil0,243

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,160
Écart entre enseignants0,155 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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