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Enregistrement W1963885049 · doi:10.1159/000328405

Refinement of the Region for Split Hand/Foot Malformation 5 on 2q31.1

2010· article· en· W1963885049 sur OpenAlexaff
Aaron Theisen, Jill A. Rosenfeld, Kate Shane-Carson, Kim L. McBride, Joan Atkin, Colette Gaba, Joe J. Hoo, Thaddeus W. Kurczynski, Rhonda E. Schnur, Lauren B. Coffey, Elaine H. Zackai, Lisa A. Schimmenti, Neil Friedman, M. Zabukovec, Susie Ball, Roberta A Pagon, Ann Lucas, Cam Brasington, J. Edward Spence, Susan Sparks, Valerie Banks, Wendy E. Smith, Tami Friedberg, Philip Wyatt, Michelle R. Aust, Raymond C. Tervo, Amy Crowley, David Skidmore, Allen N. Lamb, B. Ravnan, Trilochan Sahoo, Roger A. Schultz, Beth S. Torchia, Michael Sgro, David Chitayat, Lisa G. Shaffer

Notice bibliographique

RevueMolecular Syndromology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital limb and hand anomalies
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalUniversity of TorontoYork Central HospitalDalhousie UniversityIzaak Walton Killam Health CentreMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrocephalySyndactylyEctrodactylyGeneticsBrachydactylyGenetic heterogeneityFoot (prosody)HaploinsufficiencyMedicineBiologyPhenotypePediatricsEctodermal dysplasiaGeneShort stature

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Deletions that encompass 2q31.1 have been proposed as a microdeletion syndrome with common clinical features, including intellectual disability/developmental delay, microcephaly, cleft palate, growth delay, and hand/foot anomalies. In addition, several genes within this region have been proposed as candidates for split hand-foot malformation 5 (SHFM5). Methods: To delineate the genotype-phenotype correlation between deletions of this region, we identified 14 individuals with deletions at 2q31.1 detected by microarray analysis for physical and developmental disabilities. Results: All subjects for whom detailed clinical records were available had neurological deficits of varying degree. Seven subjects with deletions encompassing the HOXD cluster had hand/foot anomalies of varying severity, including syndactyly, brachydactyly, and ectrodactyly. Of 7 subjects with deletions proximal to the HOXD cluster, 5 of which encompassed DLX1/DLX2, none had clinically significant hand/foot anomalies. In contrast to previous reports, the individuals in our study did not display a characteristic gestalt of dysmorphic facial features. Conclusion: The absence of hand/foot anomalies in any of the individuals with deletions of DLX1/DLX2 but not the HOXD cluster supports the hypothesis that haploinsufficiency of the HOXD cluster, rather than DLX1/DLX2, accounts for the skeletal abnormalities in subjects with 2q31.1 microdeletions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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