Single nucleotide polymorphisms in the matrix metalloproteinase gene family and the frequency and duration of gastroesophageal reflux disease influence the risk of esophageal adenocarcinoma
Notice bibliographique
Résumé
The matrix metalloproteinase (MMP) family of proteins mediates various cellular pathways, including apoptosis and angiogenesis. Polymorphisms of MMP genes are associated with increased esophageal adenocarcinoma (EAC) risk. Gastroesophageal reflux disease (GERD) is an established EAC risk factor. We examined whether MMP polymorphism-EAC risk is modified by GERD. In total, 309 EAC patients and 279 frequency-matched healthy controls underwent MMP1 1G/2G, MMP3 6A/5A, MMP12 -82A/G and MMP12 1082A/G genotyping. Questionnaires collected GERD history. EAC risk was analyzed using logistic regression, adjusted for key covariates and stratified by GERD. Joint effects models explored GERD severity and duration, whereas additional models explored genotype-GERD interactions in EAC risk. We determined that each MMP1 and MMP3 minor (variant) allele was independently associated with increased EAC risk (adjusted odds ratio (AOR) 3.2, 95% confidence interval (CI) 2.0-5.1, p < 0.001 and AOR 1.8, 95% CI 1.1-2.7, p = 0.01, respectively) only among those with GERD but not in GERD-free individuals (all p = nonsignificant). There were significant interactions between the MMP1 variants and the presence of GERD (p = 0.002) and between MMP3 variants and GERD (p = 0.04). There was an equally strong interaction between cumulative GERD severity and MMP1 (p = 0.002). The AOR of each variant allele was 14.9 (95% CI 1.6-136) for individuals with severe GERD, 1.7 (95% CI 1.0-2.7) for mild-moderate GERD and 0.98 (95% CI 0.7-1.4) for those without GERD. This was further reflected in separate analyses of frequency and duration of GERD. In conclusion, MMP1 1G/2G (and possibly MMP3 6A/5A) polymorphisms alter EAC risk differentially for GERD and GERD-free individuals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».