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Enregistrement W1964075593 · doi:10.1186/1471-2202-9-52

A naturally occurring omega current in a Kv3 family potassium channel from a platyhelminth

2008· article· en· W1964075593 sur OpenAlexafffund
Tara Klassen, Andrew N. Spencer, Warren J. Gallin

Notice bibliographique

RevueBMC Neuroscience · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensVancouver Island UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPotassium channelCurrent (fluid)OmegaNeuroscienceInward-rectifier potassium ion channelComputer scienceIon channelBiologyMedicinePhysicsEndocrinologyInternal medicineReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Voltage-gated ion channels are membrane proteins containing a selective pore that allows permeable ions to transit the membrane in response to a change in the transmembrane voltage. The typical selectivity filter in potassium channels is formed by a tetrameric arrangement of the carbonyl groups of the conserved amino-acid sequence Gly-Tyr-Gly. This canonical pore is opened or closed by conformational changes that originate in the voltage sensor (S4), a transmembrane helix with a series of positively charged amino acids. This sensor moves through a gating pore formed by elements of the S1, S2 and S3 helices, across the plane of the membrane, without allowing ions to pass through the membrane at that site. Recently, synthetic mutagenesis studies in the Drosophila melanogaster Shaker channel and analysis of human disease-causing mutations in sodium channels have identified amino acid residues that are integral parts of the gating-pore; when these residues are mutated the proteins allow a non-specific cation current, known as the omega current, to pass through the gating-pore with relatively low selectivity. RESULTS: The N.at-Kv3.2 potassium channel has an unusual weak inward rectifier phenotype. Several mutations of two amino acids in the voltage sensing (S4) transmembrane helix change the phenotype to a typical delayed rectifier. The inward rectifier channels (wild-type and mutant) are sensitive to 4-aminopyridine (4-AP) but not tetra-ethyl ammonium (TEA), whereas the delayed rectifier mutants are sensitive to TEA but not 4-AP. The inward rectifier channels also manifest low cation selectivity. The relative selectivity for different cations is sensitive to specific mutations in the S4 helix, CONCLUSION: N.at-Kv3.2, a naturally occurring potassium channel of the Kv3 sequence family, mediates ion permeation through a modified gating pore, not the canonical, highly selective pore typical of potassium channels. This channel has evolved to yield qualitatively different ion permeability when compared to all other members of this gene family.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,901
Score d'incertitude au seuil0,503

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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