MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1964086204 · doi:10.1371/journal.pone.0076028

The Antifungal Eugenol Perturbs Dual Aromatic and Branched-Chain Amino Acid Permeases in the Cytoplasmic Membrane of Yeast

2013· article· en· W1964086204 sur OpenAlexafffund
Emad Darvishi, Mansoor Omidi, Ali Akbar Shahnejat Bushehri, Ashkan Golshani, Myron L. Smith

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFermentation and Sensory Analysis
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésEugenolPermeaseBiochemistryMutantYeastAmino acidSaccharomyces cerevisiaeBiologyAromatic amino acidsVacuoleMode of actionCytoplasmGeneChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eugenol is an aromatic component of clove oil that has therapeutic potential as an antifungal drug, although its mode of action and precise cellular target(s) remain ambiguous. To address this knowledge gap, a chemical-genetic profile analysis of eugenol was done using ∼4700 haploid Saccharomyces cerevisiae gene deletion mutants to reveal 21 deletion mutants with the greatest degree of susceptibility. Cellular roles of deleted genes in the most susceptible mutants indicate that the main targets for eugenol include pathways involved in biosynthesis and transport of aromatic and branched-chain amino acids. Follow-up analyses showed inhibitory effects of eugenol on amino acid permeases in the yeast cytoplasmic membrane. Furthermore, phenotypic suppression analysis revealed that eugenol interferes with two permeases, Tat1p and Gap1p, which are both involved in dual transport of aromatic and branched-chain amino acids through the yeast cytoplasmic membrane. Perturbation of cytoplasmic permeases represents a novel antifungal target and may explain previous observations that exposure to eugenol results in leakage of cell contents. Eugenol exposure may also contribute to amino acid starvation and thus holds promise as an anticancer therapeutic drug. Finally, this study provides further evidence of the usefulness of the yeast Gene Deletion Array approach in uncovering the mode of action of natural health products.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,161 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetFermentation and Sensory AnalysisTravaux en français237 207