Comparison of genetic diversity between Canadian adapted genotypes and exotic germplasm of soybean
Notice bibliographique
Résumé
Soybean (Glycine max (L.) Merr.) was domesticated in China and the greatest genetic diversity for this species is found in Asia. In contrast, in North America, soybean cultivars trace back to a small number of plant introductions from Asia and genetic diversity is typically quite limited. The purpose of this work was to measure and compare the genetic diversity in two sets of soybean lines. The first set (termed "local") was composed of 100 lines used in a private breeding program in Quebec. The second set (termed "exotic") was composed of 200 lines from elsewhere in the world (but mostly from Asia) and included a few lines of Glycine soja, the wild progenitor of cultivated soybean. Almost all the genotypes belonged to maturity groups between 000 and II. A total of 39 microsatellites (SSRs) were used to genotype the two collections. The number of alleles per locus was almost twice as great in the exotic set compared with the local set. Also, the number of "unique" alleles, i.e., those uniquely present in one set and absent in the other, was almost fivefold greater (191 vs. 37) in a subset of 108 exotic lines with good adaptation than among the local set. A genetic distance matrix, a UPGMA cluster analysis, and a principal coordinate analysis were conducted based on the SSR data. These analyses all indicated that the exotic set was much more diverse and formed a clearly distinct group from the local set. Interestingly, some of the lines showing the best adaptation to local conditions were quite distinctive in terms of their genotype and could potentially contribute useful novel genetic variation within the breeding program.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».