Cellular adaptation to low oxygen availability by a switch in the protein synthesis machinery
Notice bibliographique
Résumé
Protein synthesis is a classic molecular mechanism of cell biology that is taught in introductory biology classrooms. It involves the translation of messenger ribonucleic acid (mRNA) information into proteins, the building blocks of life. The initial step of protein synthesis consists of the eu¬karyotic translation initiation factor 4E (eIF4E) binding to the 5’cap of mRNAs. A variety of stress¬es repress translation to conserve energy because protein synthesis requires over half of a cell’s energy supply. An important stress for multicellular animals is low oxygen availability (hypoxia). This causes a repression of cap-directed translation by inhibiting eIF4E. This raises a fundamental question in cell biology as to how proteins are synthesized in periods of oxygen scarcity and eIF4E inhibition. Here, we describe an oxygen-regulated translation initiation complex that mediates selective cap-dependent protein synthesis. Hypoxia stimulates the formation of a complex that in¬cludes the oxygen-regulated hypoxia-inducible factor 2α (HIF-2α), the RNA binding protein RBM4 and the cap-binding eIF4E2, an eIF4E homologue. We also identified an RNA hypoxia response ele¬ment (rHRE) that recruits this complex to a wide array of mRNAs, including the epidermal growth factor receptor (EGFR), which plays a role in growth signaling and proliferation. Once assembled at the rHRE, HIF-2α/RBM4/eIF4E2 captures the 5’cap and targets mRNAs for active translation thereby evading hypoxia-induced repression of protein synthesis. These findings demonstrate that cells have evolved a program whereby oxygen availability switches the basic translation initiation machinery.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».