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Enregistrement W1964176895 · doi:10.1038/bjc.2013.769

FGF receptor genes and breast cancer susceptibility: results from the Breast Cancer Association Consortium

2014· article· en· W1964176895 sur OpenAlexafffund
Divyansh Agarwal, Sílvia Pineda, Kyriaki Michailidou, Jesús Herránz, Guillermo Pita, Leticia T. Moreno, M. Rosario Alonso, Joe Dennis, Qin Wang, Manjeet K. Bolla, Kerstin B. Meyer, Primitiva Menéndez‐Rodríguez, David Hardisson, Marta Mendiola, Anna González‐Neira, Annika Lindblom, Sara Margolin, Anthony J. Swerdlow, Alan Ashworth, Nick Orr, Michael E. Jones, Keitaro Matsuo, Hidemi Ito, Hiroji Iwata, Naoto Kondo, Mikael Hartman, Hui Miao, Wei Yen Lim, P T-C Iau, Emma Sawyer, Ian Tomlinson, Michael J. Kerin, Nicola Miller, Daehee Kang, J-Y Choi, S K Park, D‐Y Noh, JL Hopper, Daniel F. Schmidt, Enes Makalic, Melissa C. Southey, Soo‐Hwang Teo, Cheng Har Yip, Kavitta Sivanandan, W-T Tay, Hiltrud Brauch, T Brüning, Ute Hamann, Alison M. Dunning, Mitul Shah, Irene L. Andrulis, Julia A. Knight, Gord Glendon, Sandrine Tchatchou, Marjanka K. Schmidt, Annegien Broeks, Efraim H. Rosenberg, Laura J. van’t Veer, Peter A. Fasching, Stefan P. Renner, Arif B. Ekici, Matthias W. Beckmann, C-N Hsiung, JC Yu, MF Hou, William J. Blot, Qiuyin Cai, Anna H. Wu, Tseng Cc, David Van Den Berg, Daniel O. Stram, Angela Cox, Ian W. Brock, Malcolm Reed, Kenneth Muir, A. Lophatananon, Sarah Stewart‐Brown, Pornthep Siriwanarangsan, Wei Zheng, Sandra Deming-Halverson, Martha J. Shrubsole, Jirong Long, X-O Shu, Wei Lu, Gao Yt, B Zhang, Paolo Radice, Paolo Peterlongo, Siranoush Manoukian, Frédérique Mariette, S Sangrajrang, James McKay, Fergus J. Couch, Amanda E. Toland, Drakoulis Yannoukakos, Olivia Fletcher, Nichola Johnson, I dos Santos Silva, Julian Peto, Frederik Marmé, Barbara Burwinkel, Pascal Guénel, Thérèse Truong, Marie-Pierre Sanchez, Claire Mulot, Stig E. Bojesen, Børge G. Nordestgaard, H Flyer, Hermann Brenner, Aida Karina Dieffenbach, Volker Arndt, C Stegmaier, Vesa Kataja, V‐M Kosma, Jaana M. Hartikainen, Diether Lambrechts, Betül T. Yesilyurt, Giuseppe Floris, Karin Leunen, Jenny Chang‐Claude, Anja Rudolph, Petra Seibold, Dieter Flesch‐Janys, Xiaoyang Wang, Janet E. Olson, Celine M. Vachon, Kristen S. Purrington, Graham G. Giles, Gianluca Severi, Laura Baglietto, C. A. Haiman, Brian E. Henderson, Fredrick R. Schumacher, L. Le Marchand, Jacques Simard, Martine Dumont, Mark S. Goldberg, France Labrèche, Robert Winqvist, Katri Pylkäs, Arja Jukkola‐Vuorinen, Mervi Grip, Peter Devilee, Rob A.�E.�M. Tollenaar, Caroline Seynaeve, Montserrat García‐Closas, Stephen J. Chanock, Jolanta Lissowska, Jonine D. Figueroa, Kamila Czene, Mikael Eriksson, Keith Humphreys, Hassan Darabi, Maartje J. Hooning, Mieke Kriege, J. Margriet Collée, Madeleine A Tilanus-Linthorst, Jingmei Li, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Katarzyna Jaworska–Bieniek, Katarzyna Durda, Heli Nevanlinna, Taru Muranen, Kristiina Aittomäki, Carl Blomqvist, Natalia Bogdanova, Thilo Dörk, Per Hall, Georgia Chenevix‐Trench, Douglas F. Easton, Paul D.P. Pharoah, José-Ignacio Arias-Pérez, Pilar Zamora, Javier Benı́tez, Roger L. Milne

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFibroblast Growth Factor Research
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill UniversityRoyal Victoria Regional Health CentreUniversité de MontréalUniversité LavalRoyal Victoria HospitalCentre hospitalier universitaire de QuébecAmgen (Canada)Public Health OntarioUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandNational Cancer InstituteInstitute of Biomedical Sciences, Academia SinicaUniversitätsklinikum Hamburg-EppendorfCanadian Institutes of Health ResearchU.S. ArmyNational Institutes of HealthNational University Health SystemBiomedical Research CouncilFakultet Medicinskih Nauka, Univerziteta U KragujevcuMinistero dello Sviluppo EconomicoAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailInstitut National Du CancerMedizinischen Hochschule HannoverAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroKWF KankerbestrijdingNational Health and Medical Research CouncilUniversiti MalayaAcademia SinicaKuopion Yliopistollinen SairaalaYale UniversityKarolinska InstitutetOvarian Cancer Research FundBundesministerium für Bildung und ForschungMinisterio de Economía y CompetitividadRobert Bosch StiftungKementerian Sains, Teknologi dan InovasiKing's College LondonAcademy of FinlandAgence Nationale de la RechercheMedical Research CouncilUniversity of GalwayCancerfondenNational University of IrelandNational Science CouncilStockholms Läns LandstingSingapore Eye Research InstituteSeoul National UniversityNational Breast Cancer FoundationEuropean CommissionDeutsche KrebshilfeUniversity of OxfordWellcome TrustFondation du cancer du sein du QuébecRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnBreast Cancer Research TrustCHIST-ERACancer Council TasmaniaWorld Health OrganizationNational University of SingaporeCancer Research UKNorges ForskningsrådQIMR Berghofer Medical Research InstituteNational Institute for Health and Care ResearchItä-Suomen YliopistoLon V. Smith FoundationMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungCancer Research UK Cambridge Institute, University of CambridgeDavid F. and Margaret T. Grohne Family FoundationLigue Contre le CancerDeutsches KrebsforschungszentrumCollege of Medicine, Seoul National UniversityVirginia Department of HealthUniversity of TorontoOhio State UniversityPeter MacCallum Cancer CentreHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriFondation de FranceCalifornia Breast Cancer Research ProgramBreast Cancer Research FoundationCancer Council VictoriaCalifornia Department of Public HealthNational Medical Research CouncilMinistério da Ciência, Tecnologia e InovaçãoEuropean Social FundMenzies Centre for Australian Studies, King's College London, University of LondonCancer Research Institute
Mots-clésBreast cancerOdds ratioSingle-nucleotide polymorphismCancerOncologyCase-control studyRisk factorInternal medicineBreast diseaseMedicineBiologyGenotypeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Breast cancer is one of the most common malignancies in women. Genome-wide association studies have identified FGFR2 as a breast cancer susceptibility gene. Common variation in other fibroblast growth factor (FGF) receptors might also modify risk. We tested this hypothesis by studying genotyped single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and imputed SNPs in FGFR1, FGFR3, FGFR4 and FGFRL1 in the Breast Cancer Association Consortium. METHODS: Data were combined from 49 studies, including 53 835 cases and 50 156 controls, of which 89 050 (46 450 cases and 42 600 controls) were of European ancestry, 12 893 (6269 cases and 6624 controls) of Asian and 2048 (1116 cases and 932 controls) of African ancestry. Associations with risk of breast cancer, overall and by disease sub-type, were assessed using unconditional logistic regression. RESULTS: Little evidence of association with breast cancer risk was observed for SNPs in the FGF receptor genes. The strongest evidence in European women was for rs743682 in FGFR3; the estimated per-allele odds ratio was 1.05 (95% confidence interval=1.02-1.09, P=0.0020), which is substantially lower than that observed for SNPs in FGFR2. CONCLUSION: Our results suggest that common variants in the other FGF receptors are not associated with risk of breast cancer to the degree observed for FGFR2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,469
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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