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Enregistrement W1964260887 · doi:10.1094/pdis-06-12-0530-pdn

First Report of <i>Magnaporthe poae</i>, Cause of Summer Patch Disease on Annual Bluegrass, in Canada

2012· article· en· W1964260887 sur OpenAlexaffabout
M. M. I. Bassoriello, K.S. Jordan

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMyceliumPotato dextrose agarPoa annuaSodium hypochloriteFungusPathogenic fungusBotanyHorticultureHyphaAgrostis stoloniferaInternal transcribed spacerAgarGeneBacteriaWeed

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ectotrophic, root-infecting fungus Magnaporthe poae Landschoot & Jackson, the causal agent of summer patch disease in the U.S. (2), is implicated in the damage and loss of annual bluegrass (Poa annua L.) on golf course greens. This pathogenic fungus, one of the important root pathogens of turfgrass, attacks and colonizes susceptible turfgrass roots suffering from environmental or cultural stresses. Over 100 turf samples that exhibited symptoms (chlorotic circular or irregular patches of ≥15 cm in diameter with necrotic crowns and discolored roots) reminiscent of summer patch were collected from 77 southwestern Ontario golf courses from July to August of 2009 and 2010. Roots and crowns were often covered with dark, ectotrophic runner hyphae, lobed hyphopodia, and growth cessation structures, characteristic of M. poae. Sections of root tissue were surface sterilized in 0.6% sodium hypochlorite (NaOCl) for 5 min. Sterilized root tissue was plated on potato dextrose agar (PDA) containing 50 mg L–1 streptomycin sulfate and incubated at 28°C for 7 to 10 days. A fungus with morphological characteristics (hyaline mycelium that appears gray or olive-brown when mature) similar to those of M. poae (1) was consistently isolated (≥100 isolates were obtained) and used to identify M. poae through molecular techniques and Koch's postulates. DNA was extracted from the fungal mycelium of the collected isolates using the PowerPlant DNA isolation kit (MO BIO Laboratories, Inc., Carlsbad, CA). The rDNA internal transcribed spacer (ITS) regions of the isolates (≥100 isolates) were amplified by PCR using universal fungal rDNA primers ITS 4 (5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′) and ITS 5 (5′- GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3′) (3). The purified PCR products were sequenced (GenBank Accession No. JX134588 through JX134601) and a BLAST search exhibited seven isolates with 99% (MAG3, MAG6, MAG13, MAG16, and MAG17) and 100% (MAG1 and MAG14) similarity to M. poae in the GenBank database. Pathogenicity of four isolates (MAG1, MAG3, MAG6, and MAG14) was confirmed with Koch's postulates. Sixteen healthy P. annua core samples (four replicates of each treatment/isolate) collected from an Ontario golf course were inoculated with 25 mg M. poae-infested Kentucky bluegrass seed (Poa pratensis L.; 12.5 mg inoculum applied at the surface of the potting medium and 12.5 mg inoculum applied on the foliar surface) and were placed in a growth chamber with 12-h day/night cycles at 30/25°C and approximate relative humidity. After 2 to 3 weeks, inoculated plants exhibited chlorotic foliage and necrotic roots covered with dark ectotrophic runner hyphae and lobed hyphopodia. Infected root sections from each replication were surface sterilized and placed on PDA containing 50 mg L–1 streptomycin sulfate. The fungal cultures exhibited morphological characteristics consistent with M. poae (1). To our knowledge, this is the first report of summer patch caused by M. poae in Canada. References: (1) B. B. Clarke and A. B. Gould, eds. Turfgrass Patch Diseases Caused by Ectotrophic Root-Infecting Fungi. The American Phytopathological Society, St. Paul, MN, 1993. (2) P. J. Landschoot and N. Jackson. Mycol. Res. 93:59, 1989. (3) T. J. White et al. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. Pages 315-322 in: PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications. M. A. Innis et al. eds. Academic Press, San Diego, CA, 1990.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,084
Score d'incertitude au seuil0,170

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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