An administrative data merging solution for dealing with missing data in a clinical registry: adaptation from ICD-9 to ICD-10
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: We have previously described a method for dealing with missing data in a prospective cardiac registry initiative. The method involves merging registry data to corresponding ICD-9-CM administrative data to fill in missing data 'holes'. Here, we describe the process of translating our data merging solution to ICD-10, and then validating its performance. METHODS: A multi-step translation process was undertaken to produce an ICD-10 algorithm, and merging was then implemented to produce complete datasets for 1995-2001 based on the ICD-9-CM coding algorithm, and for 2002-2005 based on the ICD-10 algorithm. We used cardiac registry data for patients undergoing cardiac catheterization in fiscal years 1995-2005. The corresponding administrative data records were coded in ICD-9-CM for 1995-2001 and in ICD-10 for 2002-2005. The resulting datasets were then evaluated for their ability to predict death at one year. RESULTS: The prevalence of the individual clinical risk factors increased gradually across years. There was, however, no evidence of either an abrupt drop or rise in prevalence of any of the risk factors. The performance of the new data merging model was comparable to that of our previously reported methodology: c-statistic = 0.788 (95% CI 0.775, 0.802) for the ICD-10 model versus c-statistic = 0.784 (95% CI 0.780, 0.790) for the ICD-9-CM model. The two models also exhibited similar goodness-of-fit. CONCLUSION: The ICD-10 implementation of our data merging method performs as well as the previously-validated ICD-9-CM method. Such methodological research is an essential prerequisite for research with administrative data now that most health systems are transitioning to ICD-10.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,061 | 0,113 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».