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Enregistrement W1964318336 · doi:10.1089/omi.2010.0022

Standardization and Omics Science: Technical and Social Dimensions Are Inseparable and Demand Symmetrical Study

2010· review· en· W1964318336 sur OpenAlexafffund
Christina Holmes, Fiona McDonald, Mavis Jones, Vural Özdemir, Janice Graham

Notice bibliographique

RevueOMICS A Journal of Integrative Biology · 2010
Typereview
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueResearch Data Management Practices
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversity of CalgaryDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésStandardizationInteroperabilityEngineering ethicsFlexibility (engineering)Quality (philosophy)LegitimacyRealmProcess (computing)Data scienceKnowledge managementPolitical scienceComputer scienceEngineeringManagementWorld Wide WebPoliticsLaw

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Standardization is critical to scientists and regulators to ensure the quality and interoperability of research processes, as well as the safety and efficacy of the attendant research products. This is perhaps most evident in the case of "omics science," which is enabled by a host of diverse high-throughput technologies such as genomics, proteomics, and metabolomics. But standards are of interest to (and shaped by) others far beyond the immediate realm of individual scientists, laboratories, scientific consortia, or governments that develop, apply, and regulate them. Indeed, scientific standards have consequences for the social, ethical, and legal environment in which innovative technologies are regulated, and thereby command the attention of policy makers and citizens. This article argues that standardization of omics science is both technical and social. A critical synthesis of the social science literature indicates that: (1) standardization requires a degree of flexibility to be practical at the level of scientific practice in disparate sites; (2) the manner in which standards are created, and by whom, will impact their perceived legitimacy and therefore their potential to be used; and (3) the process of standardization itself is important to establishing the legitimacy of an area of scientific research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,024
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,024
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,998
Score d'incertitude au seuil0,126

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0240,024
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0090,012
Études des sciences et des technologies0,0020,015
Communication savante0,0080,016
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0060,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,445
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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