Cell Surface Electrochemical Heterogeneity of the Fe(III)-Reducing Bacteria <i>Shewanella putrefaciens</i>
Notice bibliographique
Résumé
Acid-base titration experiments and electrostatic force microscopy (EFM) were used to investigate the cell surface electrochemical heterogeneity of the Fe(III)-reducing bacteria, Shewanella putrefaciens. The acid-base titrations extended from pH 4 to 10, and the titration data were fit using a linear programming pKa spectrum approach. Overall, a five-site model accounted for the observed titration behavior with the most acidic sites corresponding to carboxylic groups and phosphodiester groups, intermediate sites phosphoryl groups, and two basic sites equivalent to amine or hydroxyl groups. The pH for the point of zero charge on the bacteria was 5.4. In EFM images of cells rinsed in solutions at pH 4.0, 7.0, and 8.0, a pronounced increase in small (< or = 100 nm diameter) high contrast patches was observed on the cells with increasing pH. The pH dependence of EFM image contrast paralleled the pattern of cell surface charge development inferred from the titration experiments; however, quantitative analysis of high contrast regions in the EFM images yielded lower surface charge values than those anticipated from the titration data. For example at pH 7, the calculated surface charge of high contrast regions in EFM images of the bacterial cells was -0.23 microC/cm2 versus -20.0 microC/cm2 based on the titration curve. The differences in surface charge estimates between the EFM images and titration data are consistent not only with charge development throughout the entire volume of the bacterial cell wall (i.e., in association with functional groups that are not directly exposed at the cell surface) but also with the presence of a thin structural layer of water containing charge-compensating counterions. In combination, the pKa spectra and EFM data demonstrate that a particularly high degree of electrochemical heterogeneity exists within the cell wall and at the cell surface of S. putrefaciens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».