Water proton configurations in structures I, II, and H clathrate hydrate unit cells
Notice bibliographique
Résumé
Position and orientation of water protons need to be specified when the molecular simulation studies are performed for clathrate hydrates. Positions of oxygen atoms in water are experimentally determined by X-ray diffraction analysis of clathrate hydrate structures, but positions of water hydrogen atoms in the lattice are disordered. This study reports a determination of the water proton coordinates in unit cell of structure I (sI), II (sII), and H (sH) clathrate hydrates that satisfy the ice rules, have the lowest potential energy configuration for the protons, and give a net zero dipole moment. Possible proton coordinates in the unit cell were chosen by analyzing the symmetry of protons on the hexagonal or pentagonal faces in the hydrate cages and generating all possible proton distributions which satisfy the ice rules. We found that in the sI and sII unit cells, proton distributions with small net dipole moments have fairly narrow potential energy spreads of about 1 kJ∕mol. The total Coulomb potential on a test unit charge placed in the cage center for the minimum energy∕minimum dipole unit cell configurations was calculated. In the sI small cages, the Coulomb potential energy spread in each class of cage is less than 0.1 kJ∕mol, while the potential energy spread increases to values up to 6 kJ∕mol in sH and 15 kJ∕mol in the sII cages. The guest environments inside the cages can therefore be substantially different in the sII case. Cartesian coordinates for oxygen and hydrogen atoms in the sI, sII, and sH unit cells are reported for reference.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».