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Enregistrement W1964404407 · doi:10.1128/jb.00788-06

Characterization of the <i>Moraxella catarrhalis</i> Opa-Like Protein, OlpA, Reveals a Phylogenetically Conserved Family of Outer Membrane Proteins

2006· article· en· W1964404407 sur OpenAlexaff
Michael J. Brooks, Cassie A. Laurence, Eric J. Hansen, Scott D. Gray‐Owen

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésMoraxella catarrhalisBiologyBacterial outer membraneMoraxella (Branhamella) catarrhalisBacterial adhesinNeisseriaMembrane proteinMicrobiologyConserved sequenceProtein familyPilusPeptide sequenceBacteriaGeneVirulenceGeneticsHaemophilus influenzaeEscherichia coliMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Moraxella catarrhalis is a human-restricted pathogen that can cause respiratory tract infections. In this study, we identified a previously uncharacterized 24-kDa outer membrane protein with a high degree of similarity to Neisseria Opa protein adhesins, with a predicted beta-barrel structure consisting of eight antiparallel beta-sheets with four surface-exposed loops. In striking contrast to the antigenically variable Opa proteins, the M. catarrhalis Opa-like protein (OlpA) is highly conserved and constitutively expressed, with 25 of 27 strains corresponding to a single variant. Protease treatment of intact bacteria and isolation of outer membrane vesicles confirm that the protein is surface exposed yet does not bind host cellular receptors recognized by neisserial Opa proteins. Genome-based analyses indicate that OlpA and Opa derive from a conserved family of proteins shared by a broad array of gram-negative bacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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