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Enregistrement W1964454348 · doi:10.1021/bi800492c

Dramatic Differences in the Roles in Lipid Metabolism of Two Isoforms of Diacylglycerol Kinase

2008· article· en· W1964454348 sur OpenAlexaff
Stephen Milne, Pavlina T. Ivanova, Michelle D. Armstrong, David S. Myers, Jovana Lubarda, Yulia V. Shulga, Matthew K. Topham, H. Alex Brown, Richard M. Epand

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer Institute
Mots-clésDiacylglycerol kinaseGlycerophospholipidsPhosphatidic acidGlycerophospholipidLipid signalingKnockout mouseBiochemistryChemistryLipid metabolismDiglycerideEndoplasmic reticulumCell biologyBiologyPhospholipidKinaseProtein kinase CFatty acidEnzymeGeneMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lipid species changes for SV40-transformed fibroblasts from wild-type or from diacylglycerol kinase-epsilon (DGKepsilon) or diacylglycerol kinase-alpha (DGKalpha) knockout mice were determined for glycerophospholipids, polyphosphatidylinositides (GPInsP n ) and diacylglycerol (DAG) using direct infusion mass spectrometry. Dramatic differences in arachidonate (20:4 fatty acid)-containing lipids were observed for multiple classes of glycerophospholipids and polyphosphatidylinositides between wild-type and DGKepsilon knockout cells. However, no difference was observed in either the amount or the acyl chain composition of DAG between DGKepsilon knockout and wild-type cells, suggesting that DGKepsilon catalyzed the phosphorylation of a minor fraction of the DAG in these cells. The differences in arachidonate content between the two cell lines were greatest for the GPInsP n lipids and lowest for DAG. These findings indicate that DGKepsilon plays a significant role in determining the enrichment of GPInsP n with 20:4 and that there is a pathway for the selective translocation of arachidonoyl phosphatidic acid from the plasma membrane to the endoplasmic reticulum. In contrast, no substantial difference was observed in the acyl chain composition of any class of glycerophospholipid or diacylglycerol between lipid extracts from fibroblasts from wild-type mice or from DGKalpha knockout mice. However, the cells from the DGKalpha knockout mice had a higher concentration of DAG, consistent with the lack of downregulation of the major fraction of DAG by DGKalpha, in contrast with DGKepsilon that is primarily responsible for enrichment of GPInsP n with arachidonoyl acyl chains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,467

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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