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Enregistrement W1964457846 · doi:10.1046/j.1529-8817.2001.00160.x

MOLECULAR SYSTEMATICS OF THE FLORIDEOPHYCEAE (RHODOPHYTA) USING NUCLEAR LARGE AND SMALL SUBUNIT rDNA SEQUENCE DATA

2001· article· en· W1964457846 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeMaximum parsimonyLineage (genetic)GigartinalesEvolutionary biologyPhylogeneticsSystematicsTaxonCladeGeneticsBotanyGeneTaxonomy (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sequence data are presented for approximately 85% of the nuclear large subunit (LSU) rDNA gene for one member of the Bangiophyceae and 47 members of the Florideophyceae, the latter representing all but one of the currently recognized florideophyte orders. Distance, parsimony, and maximum likelihood analyses of these data were used to generate phylogenetic trees, and bootstrap resampling was implemented to infer robustness for distance and parsimony results. LSU phylogenies were congruent with published nuclear small subunit (SSU) rDNA results in that four higher level florideophyte lineages were resolved: lineage 1, containing the order Hildenbrandiales; lineage 2, recovered only under distance analysis, composed of the orders Acrochaetiales, Balliales, Batrachospermales, Corallinales, Nemaliales, Palmariales, and Rhodogorgonales; lineage 3, containing the Ahnfeltiales; and lineage 4, composed of the orders Bonnemaisoniales, Ceramiales, Gelidiales, Gigartinales, Gracilariales, Halymeniales, Plocamiales, and Rhodymeniales. Analyses were also performed on a combined LSU–SSU data set and an SSU‐only data set to account for differences in taxon sampling relative to published studies using this latter gene. Combined LSU–SSU analyses resulted in phylogenetic trees of similar topology and support to those obtained from LSU‐only analyses. Phylogenetic trees produced from SSU‐only analyses differed somewhat in particulars of branching within lineages 2 and 4 but overall were congruent with the LSU‐only and combined LSU–SSU results. We close with a discussion of the phylogenetic potential that the LSU has displayed thus far for resolving relationships within the Florideophyceae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,452
Score d'incertitude au seuil0,308

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle