Conformational Analysis of Endothelin-1 Analogs with Indolizidinone Amino Acids Incorporated at the C-Terminus
Notice bibliographique
Résumé
In light of the fact that a beta-turn conformation at the C-terminus of endothelin-1 (ET-1) could be responsible for activity at the ET(B) receptor, the incorporation of (3S, 6S, 9S)-2-oxo-3-amino-1-azabicyclo[4.3.0]nonane-9-carboxylic acid (IAA) should provide an elegant method to establish whether a formyl group on Trp21 plays a role in stabilizing a beta-turn. Eight linear ET-1 analogs, four formylated and four nonformylated, ET-1-(Leu17-Asp18-IAA-Trp21); ET-1-(Leu17-IAA-Ile20-Trp21); ET-1-(Leu17-Asp18-Pro19-Ile20-Trp21) and ET-1-(Leu17-Asp 8-Ile19-Pro20-Trp21) have been analyzed by high-resolution nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy and molecular modeling. Two-dimensional double quantum filtered correlation spectroscopy (DQFCOSY), total correlation spectroscopy (TOCSY) and nuclear Overhausen enhancement spectroscopy (NOESY) were resolved and analyzed for each molecule. Interspatial distance constraints were derived from the intensity of the NOESY connectivities, The formation of hydrogen bonding was monitored from the temperature-dependence of the NH chemical shifts. Molecular models calculated by means of distance geometry, simulated annealing and energy minimization, suggested a global elongated structure for the formylated analogs and a folded arrangement for the nonformylated derivatives, but no hydrogen bonding was detected at the C-terminus of ET-1 analogs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».