MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1964703561 · doi:10.1186/1471-2229-10-272

Habituation to thaxtomin A in hybrid poplar cell suspensions provides enhanced and durable resistance to inhibitors of cellulose synthesis

2010· article· en· W1964703561 sur OpenAlexafffund
Viviane Brochu, Marie Girard-Martel, Isabelle Duval, Sylvain Lerat, Gilles Grondin, Olivier Domingue, Carole Beaulieu, Nathalie Beaudoin

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensNatural Resources CanadaCanadian Forest ServiceUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésBiologyCelluloseHabituationCell wallCell culturePhytotoxinProgrammed cell deathPlant disease resistanceCell biologyBiochemistryBotanyGeneApoptosisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Thaxtomin A (TA), a phytotoxin produced by the phytopathogen Streptomyces scabies, is essential for the development of potato common scab disease. TA inhibits cellulose synthesis but its actual mode of action is unknown. Addition of TA to hybrid poplar (Populus trichocarpa x Populus deltoides) cell suspensions can activate a cellular program leading to cell death. In contrast, it is possible to habituate hybrid poplar cell cultures to grow in the presence of TA levels that would normally induce cell death. The purpose of this study is to characterize TA-habituated cells and the mechanisms that may be involved in enhancing resistance to TA. RESULTS: Habituation to TA was performed by adding increasing levels of TA to cell cultures at the time of subculture over a period of 12 months. TA-habituated cells were then cultured in the absence of TA for more than three years. These cells displayed a reduced size and growth compared to control cells and had fragmented vacuoles filled with electron-dense material. Habituation to TA was associated with changes in the cell wall composition, with a reduction in cellulose and an increase in pectin levels. Remarkably, high level of resistance to TA was maintained in TA-habituated cells even after being cultured in the absence of TA. Moreover, these cells exhibited enhanced resistance to two other inhibitors of cellulose biosynthesis, dichlobenil and isoxaben. Analysis of gene expression in TA-habituated cells using an Affymetrix GeneChip Poplar Genome Array revealed that durable resistance to TA is associated with a major and complex reprogramming of gene expression implicating processes such as cell wall synthesis and modification, lignin and flavonoid synthesis, as well as DNA and chromatin modifications. CONCLUSIONS: We have shown that habituation to TA induced durable resistance to the bacterial toxin in poplar cells. TA-habituation also enhanced resistance to two other structurally different inhibitors of cellulose synthesis that were found to target different proteins. Enhanced resistance was associated with major changes in the expression of numerous genes, including some genes that are involved in DNA and chromatin modifications, suggesting that epigenetic changes might be involved in this process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil0,969

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMC Plant BiologyMême sujetPlant Disease Resistance and GeneticsTravaux en français237 207